当您发现起诉的公司所使用的公章是假的时，这确实是一个需要严肃对待的问题，因为它直接关系到法律程序的合法性和有效性。以下是我为您整理的详细应对步骤和建议：
一、确认公章真伪并收集证据
收集公章样本：首先，您需要收集到该假公章的样本，这可以是文件上的盖章、照片或者复印件等。
进行公章鉴定：接下来，您应该委托有资质的司法鉴定机构对收集到的公章样本进行鉴定。通过对比公司正式公章的大小、字体、纹路等特征，确定其是否为假章。
收集其他证据：除了公章样本外，您还应收集与该假公章相关的所有文件、合同、交易记录等，以及可能涉及到的证人证言，以证明该假公章的使用情况和造成的后果。
二、报警处理并咨询律师
向公安机关报案：私刻公章属于违法行为，您应立即向当地公安机关报案，并提供您收集到的所有证据。公安机关的调查报告或证明文件将对后续法律程序提供有力支持。
咨询专业律师：在报警的同时，您也应寻求专业律师的法律意见。律师可以帮助您了解自身权益、诉讼风险，并制定合适的诉讼策略。
三、准备起诉材料并提起诉讼
选择管辖法院：根据《中华人民共和国民事诉讼法》的规定，您可以选择侵权行为地或被告住所地人民法院管辖。同时，考虑案件的标的额、影响范围等因素确定管辖法院的级别。
撰写起诉状：在律师的指导下，撰写起诉状，明确原告和被告的基本信息，详细陈述诉讼请求、事实与理由，并引用相关法律法规说明被告行为的违法性。
提交起诉材料：向选定的法院提交起诉状及副本，同时提供公司主体资格证明、证据材料等。确保所有材料都按照证据清单顺序整理，以便法院审查。
缴纳诉讼费用：根据法院通知，按时缴纳诉讼费用。如果经济困难，可以向法院申请缓交、减交或免交。
四、参加庭审并等待判决
参加庭审：准时参加庭审，充分陈述事实、发表辩论意见，出示证据并对被告提供的证据进行质证。配合法院的调查和询问，如实回答问题。
等待判决与执行：庭审结束后，等待法院作出判决。如果公司胜诉，而被告不主动履行判决义务，可以向法院申请强制执行，实现公司的诉讼请求。
五、刑事报案与追责
除了民事诉讼外，私刻公章的行为还可能涉嫌刑事犯罪。根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，伪造公司印章的，可处三年以下有期徒刑、拘役、管制或剥夺政治权利，并处罚金。因此，公司应积极配合公安机关的调查，追究私刻公章者的刑事责任。
六、加强内部管理和监督
为了避免类似事件的再次发生，公司应加强内部管理和监督，完善公章使用制度。例如，可以设立专门的公章管理岗位，负责公章的保管、使用和登记等工作；同时，加强对员工的法律意识教育，让员工了解私刻公章的严重后果。
综上所述，当您发现起诉的公司所使用的公章是假的时，应立即采取行动，通过法律手段维护公司的合法权益。希望以上建议能对您有所帮助。