结论：能否以民间借贷纠纷为由起诉，需根据双方签订的委托协议具体内容、资金性质及双方真实意思表示综合判断。若协议明确约定资金为借款，则可能构成民间借贷；若协议明确约定为委托投资关系，则一般不能直接以民间借贷起诉，但可能存在其他救济途径。以下为详细分析：
一、若协议明确约定资金为借款
法律关系认定：
- 若双方签订的委托协议中明确约定，一方将资金出借给另一方，另一方用于投资基金，并约定了借款期限、利息等民间借贷的典型要素，则双方之间构成民间借贷法律关系。
起诉依据：
- 在此情况下，若基金“暴雷”导致资金无法收回，出借方可以依据《中华人民共和国民法典》中关于民间借贷的相关规定，以借款人未按约定偿还借款为由，向法院提起诉讼，要求借款人承担还款责任。
注意事项：
- 出借方需保留好委托协议、转账记录等证据，以证明双方之间存在借贷关系及借款事实。
- 若借款人抗辩称资金并非借款而是投资款，出借方需提供充分证据证明双方的真实意思表示为借贷。
二、若协议明确约定为委托投资关系
法律关系认定：
- 若双方签订的委托协议中明确约定，一方委托另一方将资金投资于基金，双方之间构成委托投资法律关系。在此关系下，委托方需承担投资风险，受托方一般仅在存在过错时承担责任。
起诉依据及限制：
- 在基金“暴雷”的情况下，若委托方直接以民间借贷为由起诉受托方，法院一般不会支持。因为双方之间并不存在借贷关系，而是委托投资关系。
- 但委托方可以依据委托投资协议，以受托方存在过错（如未尽到谨慎投资义务、未及时披露投资风险等）为由，向法院提起诉讼，要求受托方承担相应的赔偿责任。
注意事项：
- 委托方需保留好委托投资协议、转账记录、受托方投资行为的相关证据等，以证明双方之间存在委托投资关系及受托方的过错行为。
- 委托方在起诉前应仔细审查委托投资协议中的条款，了解自己的权利和义务，以及受托方的责任和义务。
三、若协议内容模糊或存在争议
法律关系认定困难：
- 若双方签订的委托协议内容模糊，未明确约定资金性质为借款还是投资款，或者双方对协议内容存在争议，则法律关系认定可能较为困难。
解决途径：
- 在此情况下，双方可以尝试通过协商、调解等方式解决争议。若协商、调解无果，则可以向法院提起诉讼，由法院根据双方提供的证据和法律规定，综合判断双方之间的法律关系及责任承担。
建议：针对您的情况，我建议您首先仔细审查双方签订的委托协议，明确协议中的条款内容及双方的真实意思表示。若协议明确约定为借贷关系，则可以考虑以民间借贷为由起诉；若协议明确约定为委托投资关系，则需考虑其他救济途径。若协议内容模糊或存在争议，则建议您咨询专业律师，以便更好地维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。