您好，关于工伤鉴定是在事发地还是公司注册地的问题，这主要取决于公司是否为职工参加了工伤保险以及具体的生产经营地情况。

首先，如果公司已经为职工参加了工伤保险，那么工伤认定通常会在公司参保地的社会保险行政部门进行。这是因为工伤保险是由社会保险行政部门负责管理的，参保地的部门对职工的参保情况有详细的记录，便于进行工伤认定。

然而，如果公司未为职工参加工伤保险，那么根据《工伤保险条例》以及人力资源社会保障部《关于执行<工伤保险条例>若干问题的意见》(二)的相关规定，工伤认定应当在“生产经营地”进行。这里的“生产经营地”指的是公司开展日常运营、管理以及提供服务的主要场所，它不仅仅局限于公司注册地，而是包括公司实际从事业务活动的地点，如货物运输的路线、船舶停靠的港口、办公场所所在地等。

以您提供的案例为例，吴某在船舶停泊在宜昌市港口等待卸货过程中发生工伤事故，虽然航运公司的注册地在河南固始，但宜昌市作为其受伤及船舶停靠的地点，可以理解为“生产经营地”。因此，吴某向宜昌市人社局申请工伤认定是符合规定的，宜昌市人社局也有权进行工伤认定。

至于劳动能力鉴定申请，根据社会保险属地管理原则，工伤职工或用人单位应到所在设区市的劳动能力鉴定委员会提出申请。申请时需要填写《劳动能力鉴定申请表》，并提供工伤认定决定书原件、工伤职工本人的身份证等有效身份证明原件以及病历资料等相关材料。

综上所述，工伤鉴定的地点主要取决于公司是否参保以及生产经营地的具体情况。如果公司已参保，则通常在参保地进行；如果未参保，则应在生产经营地进行。而劳动能力鉴定申请则应到所在设区市的劳动能力鉴定委员会提出。希望这些解答能够帮助您更好地理解工伤鉴定的相关流程。如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时告诉我。