合同到期但店铺仍在营业，起诉是否有效需分情况讨论，具体如下：

1. 若合同明确约定到期自动终止且无续约条款：

   • 法律效果：合同到期后，双方权利义务关系原则上终止。若店铺继续营业，可能构成无权占有或违约（如原合同禁止到期后继续使用场地）。此时，出租方有权起诉要求承租方腾退房屋、支付逾期占用费（通常参照原租金标准计算）或赔偿损失。
   • 关键证据：需提供合同原件、到期通知（如书面催告）、店铺持续营业的证据（如照片、视频、水电费记录等）。

2. 若合同到期后双方以实际行为续约：

   • 法律效果：根据《民法典》第七百三十四条，租赁期限届满，承租人继续使用租赁物，出租人没有提出异议的，原租赁合同继续有效，但租赁期限为不定期。此时，任何一方均可随时解除合同，但需在合理期限前通知对方。若出租方起诉要求承租方腾退，需先解除合同并给予合理期限。
   • 关键证据：需证明双方存在续约合意（如口头协议、继续支付租金的行为、出租方接受租金等）。若无法证明，可能被认定为不定期租赁。

3. 若合同到期后承租方拒不腾退且无合法依据：

   • 法律效果：出租方有权依据《民法典》第二百三十五条（返还原物请求权）起诉要求承租方返还房屋，并可主张逾期占用费（通常高于原租金，以弥补损失）。若承租方行为构成侵权，还可要求赔偿其他损失（如房屋损坏、经营损失等）。
   • 关键证据：除合同和到期通知外，需提供承租方拒不腾退的证据（如书面催告、报警记录、证人证言等）。

法律建议：

• 出租方：若合同已到期且无续约意愿，应立即书面通知承租方腾退，并保留送达证据。若承租方拒不配合，可委托律师发送律师函或直接起诉，避免损失扩大。
• 承租方：若希望继续经营，应主动与出租方协商续约事宜，并签订书面合同。若未达成一致，应及时腾退房屋，避免承担高额逾期占用费或法律责任。

风险提示：

• 若合同未明确约定到期后处理方式，双方可能因“是否续约”产生争议，需结合实际履行情况判断。
• 起诉前需确保证据充分，否则可能因举证不能而败诉。

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