协议动迁在符合一定条件下，确实可以提起行政诉讼以维护自身合法权益。以下是对此问题的详细分析：

一、协议动迁可提起行政诉讼的情况

根据2015年5月1日实施的新《行政诉讼法》及相关司法解释，行政机关为实现公共利益或行政管理目标，与公民、法人或其他组织协商订立的具有行政法上权利义务内容的行政协议，已明确纳入行政诉讼受案范围。协议动迁通常属于此类行政协议，具体原因如下：

1. 签订主体特定性：协议动迁往往由行政机关（如房屋征收部门）与被拆迁人签订，体现了行政协议的特征。行政机关在此过程中的行为是履行行政管理职责的表现。
2. 公共利益目的性：动迁多出于公共利益需要，如基础设施建设、旧城区改造等。行政机关签订动迁协议旨在实现这些目标，与其行政管理职能紧密相关。
3. 权利义务行政属性：动迁协议中规定的权利义务具有行政法上的属性，包括行政机关的监督管理权、被拆迁人的配合义务以及获得合理补偿安置的权利等。

因此，在签订、履行、变更、解除动迁协议过程中若发生纠纷，且涉及行政机关不依法履行、未按照约定履行或违法变更、解除动迁补偿协议等情况，公民、法人或其他组织有权依法提起行政诉讼。

二、特殊情况下按民事诉讼处理的可能性

值得注意的是，并非所有动迁协议纠纷都可通过行政诉讼解决。在以下特殊情况下，可能需按民事诉讼程序处理：

• 若动迁协议的一方主体非行政机关，而是民事主体（如开发商），则此类纠纷通常不属于行政诉讼范畴，而应通过民事诉讼程序解决。

三、提起诉讼前的准备工作及注意事项

在决定提起行政诉讼前，建议做好以下准备工作并注意相关事项：

1. 收集证据材料：包括但不限于动迁协议文本、相关政府文件、现场照片或视频等，以充分证明自身权益受到侵害的事实。
2. 关注诉讼时效：根据《行政诉讼法》第四十六条第一款，公民、法人或其他组织直接向人民法院提起诉讼的，应当自知道或应当知道行政机关作出具体行政行为之日起六个月内提出。若涉及不动产案件，自行政行为作出之日起超过二十年，人民法院不予受理；对于非不动产类的行政案件，自行政行为作出之日起超过五年，人民法院同样不予受理。务必确保在法定期限内提起诉讼，避免因超过时效而丧失起诉权利。
3. 了解诉讼流程：熟悉行政诉讼的起诉、受理、审理、判决等流程，以便在诉讼过程中能够更好地维护自己的合法权益。

四、法律后果

若提起行政诉讼并胜诉，法院可能会判决行政机关履行法定职责、撤销或变更违法行政行为、赔偿损失等。这将有助于维护被拆迁人的合法权益，促进动迁工作的合法、公正进行。

综上所述，协议动迁在符合行政协议特征且涉及行政机关不履行或违法履行协议等情况下，可依法提起行政诉讼。但在实际操作中，还需根据具体情况进行判断，并做好充分的准备工作以确保诉讼的成功进行。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。