在原配起诉调查第三者微信流水的情况下，通常法院会根据申请人的具体请求和案件需要，来决定是调取第三者与其老公的转账记录，还是查第三者所有的微信流水。以下是对这一问题的详细分析：
调取转账记录的情况：
- 如果原配的诉讼请求主要集中在确认第三者与其老公之间的经济往来，特别是转账行为，那么法院可能会根据申请，仅调取第三者与其老公之间的转账记录。
- 这种情况下，法院会关注转账的金额、时间、频率等，以判断是否存在不正当的经济关系，如赠与、借贷等，并据此作出相应的法律判断。
查所有微信流水的情况：
- 如果原配的诉讼请求更为广泛，或者法院认为有必要全面了解第三者的经济状况，以更准确地判断案件事实，那么法院可能会决定查第三者所有的微信流水。
- 这种情况下，法院会审查第三者微信流水的全部记录，包括与其他人的转账、消费、收入等，以获取更全面的经济信息，为案件的审理提供更充分的依据。
法律背景与建议：
- 法律背景：根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，当事人有权申请法院调查取证，法院也有权根据案件需要，决定调查取证的范围和方式。在涉及婚姻家庭纠纷的案件中，法院通常会根据当事人的请求和案件需要，灵活决定调查取证的范围。
- 建议：如果你作为原配，想要调查第三者的微信流水，建议你在起诉时明确你的诉讼请求，并尽可能提供具体的调查请求，如调取第三者与其老公的转账记录。同时，你也可以根据案件需要，向法院申请查第三者所有的微信流水，但需要说明理由和必要性。法院会根据案件情况和你的请求，作出相应的决定。
可能法律后果：
- 如果法院决定调取第三者与其老公的转账记录，并据此作出了有利于你的判决，那么第三者可能需要承担相应的法律责任，如返还不当得利等。
- 如果法院决定查第三者所有的微信流水，并发现了其他与案件相关的经济往来或行为，那么这些信息也可能成为法院审理案件的依据，对案件的判决产生影响。
总之，在处理这类案件时，建议你根据具体情况和案件需要，向法院提出合理的调查请求，并积极配合法院的调查取证工作。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。