结论：工程合同没有延期条款，实际延期时能否扣钱不能一概而论，需分情况讨论。
- 若因承包方原因导致延期
- 从合同约定缺失但法律原则角度，虽然合同没有明确延期扣钱的条款，但根据《民法典》中关于违约责任的相关规定，当事人一方不履行合同义务或者履行合同义务不符合约定的，应当承担继续履行、采取补救措施或者赔偿损失等违约责任。承包方未按合同约定的工期完成工程，属于违约行为，发包方有权要求其承担违约责任。
- 在这种情况下，如果发包方能够证明因承包方延期给自己造成了实际损失，比如因工程延期导致无法按时投入使用而产生的租金损失、商业机会损失等，发包方可以要求承包方赔偿这些实际损失。如果双方对于赔偿金额无法达成一致，发包方可以通过诉讼或仲裁等法律途径，要求法院或仲裁机构根据实际情况确定赔偿金额，在一定程度上相当于“扣钱”。
- 例如，在一个商业建筑项目中，承包方因自身施工管理不善导致工程延期三个月交付，发包方原本计划在该建筑交付后立即开展商业活动，因延期产生了三个月的租金损失以及预期的商业利润损失。发包方可以收集相关证据，如租赁合同、商业计划书、预期利润计算依据等，向承包方主张赔偿。
- 若因发包方原因导致延期
- 如果是发包方的原因导致工程延期，比如发包方未能按时提供施工场地、未能及时支付工程进度款、变更设计等，那么承包方不仅不需要承担延期责任，反而有权要求发包方承担因延期给自己造成的损失，如窝工费、设备闲置费、增加的管理费等。此时发包方不仅不能扣钱，还可能面临向承包方支付额外费用的情况。
- 例如，发包方在施工过程中突然变更设计方案，要求承包方对部分工程进行拆除重建，导致工程延期。承包方可以要求发包方支付因变更设计增加的施工成本以及因延期产生的窝工损失等费用。
- 若因不可抗力等不可预见、不可避免的因素导致延期
- 根据法律规定，因不可抗力不能履行合同的，根据不可抗力的影响，部分或者全部免除责任，但法律另有规定的除外。如果工程延期是由于不可抗力因素，如地震、洪水、台风等自然灾害，或者政府行为等不可预见、不可避免的原因导致的，双方都不需要承担违约责任，发包方也就无权扣钱。
- 例如，在某工程建设过程中，当地遭遇了百年一遇的洪水，施工现场被淹，施工设备损坏，工程无法继续进行，导致延期。这种情况下，双方应根据实际情况协商解决工期顺延等问题，发包方不能因延期而扣承包方的钱。