结论前置：在上下班途中发生非本人主要责任的交通事故，公司在承担相应赔偿责任后，确实有权向事故责任方进行追偿。以下从多个角度对此问题进行详细分析：
一、工伤认定与赔偿责任
工伤认定条件：
- 根据《工伤保险条例》第十四条第六项的规定，员工在上下班途中，受到非本人主要责任的交通事故伤害，应认定为工伤。这一规定明确了两个关键点：一是事故必须发生在上下班途中；二是员工在事故中不承担主要责任。
赔偿责任划分：
- 若公司为员工缴纳了工伤保险，员工因工伤产生的医疗费用、康复费用、住院伙食补助费等大部分费用将由工伤保险基金支付。同时，公司也需承担一定责任，如停工留薪期内的工资福利等。
- 若公司未为员工缴纳工伤保险，则原本应由工伤保险基金支付的费用将全部由公司承担。但无论哪种情况，公司承担的都是基于工伤认定的赔偿责任，而非对事故责任方的直接赔偿责任。
二、公司追偿权的法律依据
追偿权基础：
- 公司在承担工伤赔偿责任后，实际上是在为员工垫付了因事故责任方造成的损失。根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，因第三人的过错致使损害发生的，由第三人承担赔偿责任。因此，公司有权向事故责任方追偿其已垫付的赔偿费用。
追偿程序：
- 公司在行使追偿权时，应首先确保已按照工伤认定程序为员工支付了相应的赔偿费用。
- 随后，公司可以与事故责任方进行协商，要求其承担相应的赔偿责任。若协商无果，公司可以通过法律途径，如提起民事诉讼，来维护自己的合法权益。
三、实际操作中的注意事项
证据收集：
- 公司在行使追偿权时，必须收集并保存好相关证据，如工伤认定书、医疗费用发票、赔偿协议等。这些证据将作为公司向事故责任方追偿的重要依据。
时效限制：
- 公司在行使追偿权时，应注意诉讼时效的限制。根据《中华人民共和国民法典》的规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。因此，公司应在法定期限内及时行使追偿权，以免丧失胜诉权。
四、特殊情况下的处理
事故责任方无法确定或无力赔偿：
- 若事故责任方无法确定或无力赔偿，公司可能无法完全追回已垫付的赔偿费用。在这种情况下，公司可以考虑通过其他途径，如申请工伤保险基金先行支付等，来减轻自己的经济负担。
员工自身存在过错：
- 若员工在事故中也存在一定过错，如未遵守交通规则等，这可能会影响工伤认定的结果和赔偿责任的划分。但无论如何，只要员工在事故中不承担主要责任，公司仍有权向事故责任方追偿其已垫付的赔偿费用中应由责任方承担的部分。
总结与建议：在上下班途中发生非本人主要责任的交通事故时，公司在承担工伤赔偿责任后有权向事故责任方进行追偿。为确保追偿权的顺利行使，公司应收集并保存好相关证据，并在法定期限内及时行使追偿权。若遇到特殊情况或疑问，建议直接向我咨询以获取更具体的法律建议。