关于“公司罚款是否可以超过当天工资以及是否合法”的问题，这确实是一个涉及多个法律层面和实际情况考量的复杂问题。以下是我为您提供的详细解答：
一、法律层面的分析
行政处罚权的限制：
- 根据《中华人民共和国行政处罚法》，行政处罚由具有行政处罚权的行政机关实施。公司并非行政机关，因此不具备法律授予的行政处罚权，无权对员工进行罚款作为行政处罚。
工资扣除的法律规定：
- 《工资支付暂行规定》第十六条明确规定，若劳动者因本人原因给用人单位造成经济损失，用人单位可按劳动合同约定要求赔偿，并从劳动者工资中扣除。但扣除部分不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后剩余工资不得低于当地月最低工资标准。这一规定限制了公司从员工工资中扣除的金额，确保了员工的最低生活费用不受影响。
地方性法规的考量：
- 部分地方如广东省，通过地方性法规有条件地允许用人单位在规章制度中设定罚款。但即便如此，这些罚款也受到严格监管，必须确保不违反相关法律法规。若用人单位违规实施罚款或扣减工资，将面临人力资源社会保障行政部门的处罚。
二、实际情况的考量
罚款的合法依据与程序：
- 公司若要对员工进行罚款，必须有明确的规章制度作为依据，且该规章制度需经过合法程序制定并公示。同时，员工需对相关规定表示同意或知悉。若公司缺乏合法依据或未遵循法定程序进行罚款，则属于违法行为。
罚款金额的合理性：
- 即便存在合法依据，罚款金额也需合理，不得超过法定上限（即当月工资的20%），且不能影响员工的最低生活费用。若罚款超过当天工资，且累计可能导致当月扣除部分超标，则属于违法行为。
员工经济状况的考量：
- 在判断罚款是否合理时，还需考虑员工的经济状况。罚款不应对员工造成过大的经济负担，否则可能被视为不合理或违法。
三、结论与建议
- 结论：公司罚款超过当天工资在大多数情况下是违法的，除非公司有明确的合法依据、遵循了法定程序，并且罚款金额合理且不影响员工的最低生活费用。
- 建议：若您认为公司罚款行为违法，可首先与公司协商解决。协商不成时，可向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。必要时，也可寻求专业律师的帮助进行维权。
综上所述，公司罚款是否可以超过当天工资以及是否合法，需根据具体情况判断。在面对公司罚款时，您应依法维护自己的权益，通过协商、投诉或仲裁等方式寻求解决途径。