若在工程款支付流程中，施工方不同意以工抵房的方式支付工程款，可采取以下措施：
协商解决：
- 沟通协商：首先，双方应坐下来进行友好协商，明确各自的需求和顾虑。施工方可以表达不同意以工抵房的原因，比如房屋位置、价值、产权清晰度等问题。开发商或建设单位则应倾听施工方的意见，并尝试提出双方都能接受的解决方案，如调整房屋选择、提供额外的补偿或优惠等。
- 达成共识：在协商过程中，双方应努力寻找共同点，争取达成共识。如果能够通过协商找到双方都能接受的支付方式，那么问题就可以得到圆满解决。
审查合同条款：
- 合同内容：仔细审查工程款支付合同中的相关条款，特别是关于支付方式、支付时间、违约责任等方面的约定。如果合同中明确规定了工程款支付方式，且以工抵房是其中一种方式，但并未强制要求必须接受，那么施工方有权拒绝以工抵房的方式支付。
- 合同变更：如果合同中确实规定了必须以工抵房的方式支付工程款，但施工方因特殊原因无法接受，双方可以协商变更合同条款，或者签订补充协议，明确新的支付方式。
寻求法律途径：
- 法律咨询：如果协商无果，施工方可以寻求法律途径解决争议。可以咨询专业律师，了解自己的权利和义务，以及可能采取的法律措施。
- 提起诉讼或仲裁：根据合同约定或相关法律法规，施工方可以向法院提起诉讼或向仲裁机构申请仲裁，要求开发商或建设单位按照合同约定支付工程款。在诉讼或仲裁过程中，施工方需要提供充分的证据证明自己的主张，如合同、发票、施工记录等。
考虑其他支付方式：
- 现金支付：如果双方无法就以工抵房的方式达成一致，开发商或建设单位可以考虑以现金方式支付工程款。当然，这可能需要双方重新协商支付时间、支付方式等细节。
- 其他资产抵偿：除了房屋外，开发商或建设单位还可以考虑用其他资产（如车辆、设备等）来抵偿工程款。但同样需要双方协商一致，并明确资产的评估价值、产权归属等问题。
在处理此类争议时，建议双方保持冷静和理性，通过友好协商和法律途径来解决问题。如果需要更具体的法律建议或帮助，请随时向我咨询。