公司不能仅凭离职申请书就辞退员工。以下从不同角度为你详细分析：

从离职申请书的性质来看

离职申请书通常是员工向公司表达自己有离职意愿的书面文件。它本质上是员工发起的一个关于劳动关系变动的意向通知，并不等同于公司对员工的辞退决定。员工提交离职申请书后，一般还需要按照公司规定的流程办理离职手续，并且有一个离职的期限（比如提前30天以书面形式通知公司），在这个期限内，员工仍然属于公司的员工，公司不能因为员工提交了离职申请书就立即辞退员工。例如，小李向公司提交了离职申请书，打算一个月后离职，在这一个月内，公司不能以小李提交了离职申请书为由将其辞退，否则可能构成违法解除劳动合同。

从公司辞退员工的合法依据来看

公司辞退员工需要有合法的理由和依据，根据《中华人民共和国劳动合同法》的规定，公司辞退员工主要有以下几种合法情形：

1. 过失性辞退：员工存在严重违反公司规章制度、严重失职、营私舞弊给公司造成重大损害、被依法追究刑事责任等情形时，公司可以辞退员工。但这些情形的认定需要有确凿的证据支持，并且公司需要按照法定程序进行处理，不能仅仅因为员工提交了离职申请书就认定员工存在过失而辞退。比如，员工小张在工作期间严重违反公司的考勤制度，多次旷工，公司有明确的考勤记录和相关规章制度作为证据，此时公司可以依据过失性辞退的规定辞退小张，而不是因为小张提交了离职申请书。
2. 无过失性辞退：包括员工患病或者非因工负伤，在规定的医疗期满后不能从事原工作，也不能从事由公司另行安排的工作的；员工不能胜任工作，经过培训或者调整工作岗位，仍不能胜任工作的；劳动合同订立时所依据的客观情况发生重大变化，致使劳动合同无法履行，经公司与员工协商，未能就变更劳动合同内容达成协议的。在这些情况下，公司辞退员工需要提前三十日以书面形式通知员工本人或者额外支付员工一个月工资，并且需要支付相应的经济补偿。同样，这些情形的认定也需要有相关的证据和程序，不能以员工提交离职申请书为依据。例如，员工小王因患病在医疗期满后不能从事原工作，公司经过评估认为小王也不能从事另行安排的工作，此时公司可以按照无过失性辞退的规定处理，而不是因为小王提交了离职申请书就辞退他。

从违法辞退的法律后果来看

如果公司仅凭离职申请书就辞退员工，可能构成违法解除劳动合同。根据《中华人民共和国劳动合同法》的规定，公司违法解除劳动合同的，员工有权要求公司继续履行劳动合同或者要求公司支付赔偿金。赔偿金的标准是按照员工在本公司工作的年限，每满一年支付两个月工资的标准向员工支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向员工支付一个月工资的赔偿金。例如，员工小赵在公司工作了三年，公司仅因为小赵提交了离职申请书就将其辞退，小赵可以要求公司支付赔偿金，赔偿金的数额为小赵三个月的工资（3年×2个月工资/年 = 6个月工资，但因是违法解除，此处按实际应支付逻辑简化为按工作年限对应赔偿标准说明，实际计算以完整规则为准，此处重点说明违法后果的严重性）。

建议：如果你遇到了公司仅凭离职申请书就辞退你的情况，你可以先与公司进行协商，要求公司说明辞退的理由和依据。如果协商不成，你可以向当地的劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。如果你还有其他关于劳动工伤方面的问题，可以直接向我咨询。