结论：公益性岗位做满3年后，若工作单位愿意支付赔偿金，这一行为本身并不直接构成违法行为，但具体是否合法需结合实际情况判断，包括是否符合劳动合同或相关协议的约定，以及是否违反了公益性岗位的相关政策规定。
分析说明：
公益性岗位的性质与规定：
- 公益性岗位通常是由政府出资或政策扶持，用于安置就业困难人员的岗位，如社区服务、公共设施维护等。
- 这类岗位往往有一定的政策限制，如聘用期限、工资待遇、社会保险等，旨在保障就业困难人员的权益。
赔偿金的支付条件：
- 在一般情况下，赔偿金（如经济补偿金）的支付与劳动合同的解除或终止有关，且需符合《劳动合同法》等相关法律法规的规定。
- 若公益性岗位的劳动合同或相关协议中明确规定了做满一定年限后单位需支付赔偿金，且该约定不违反法律法规的强制性规定，则单位支付赔偿金是合法的。
公益性岗位的特殊政策：
- 公益性岗位可能受到特定政策的约束，如聘用期限的限制、工资待遇的补贴标准等。
- 若单位支付赔偿金的行为与这些政策相冲突，如通过支付赔偿金来规避政策对聘用期限的限制，则可能构成违法行为。
实际案例与判断：
- 在实际操作中，需结合具体的劳动合同、相关协议以及公益性岗位的政策规定来判断单位支付赔偿金的行为是否合法。
- 若单位支付赔偿金的行为既符合劳动合同或相关协议的约定，又未违反公益性岗位的相关政策规定，则该行为是合法的。
法律建议：
- 若您作为公益性岗位的员工，对单位支付赔偿金的行为有疑问，建议首先查阅您的劳动合同或相关协议，了解其中关于赔偿金的约定。
- 同时，您也可以咨询当地的劳动保障部门或就业服务机构，了解公益性岗位的相关政策规定，以便更准确地判断单位的行为是否合法。
- 若您认为单位的行为存在违法之处，且损害了您的合法权益，您可以依法向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，或向人民法院提起诉讼，以维护自己的合法权益。
可能后果：
- 若单位支付赔偿金的行为合法，则您无权要求单位停止支付或返还赔偿金。
- 若单位支付赔偿金的行为违法，则您有权要求单位停止违法行为，并可能要求单位承担相应的法律责任，如赔偿损失等。