公司让员工存休是否合法，需根据具体情况综合判断。以下是对此问题的详细分析：
合法的存休情形
双方协商一致：
- 如果公司与员工就存休（即调休或累积休息时间）进行了充分协商，并达成一致意见，且存休安排不违反法律法规的强制性规定，那么这种存休是合法的。例如，公司因业务繁忙需要员工在特定时间段加班，之后安排员工在业务空闲期进行补休，且双方对此有明确的书面或口头协议。
符合法律规定的加班与调休：
- 根据《劳动法》及相关规定，用人单位在保障劳动者身体健康的条件下，可延长工作时间，但每日不得超过三小时，每月不得超过三十六小时。若公司在法律允许的加班时长范围内，因生产经营需要安排员工加班，并在之后的工作日中安排同等时间的补休（即存休），这通常是合法的。
不合法的存休情形
未经协商一致的强制存休：
- 如果公司未经员工同意，单方面强制要求员工存休，且这种存休安排打乱了员工的正常生活节奏和休息安排，那么这种做法是不合法的。员工有权拒绝公司的强制存休要求，并可以与公司进行沟通协商，或向劳动监察部门投诉。
违反法定加班时间限制的存休：
- 若公司长期让员工处于加班状态，累计加班时间远超法定上限，且未依法支付足额加班工资，而是试图通过存休来规避法律责任，这种存休安排是不合法的。员工有权要求公司按照法律规定支付加班工资，并可以就公司的违法行为向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
存休期间不支付工资或生活费：
- 根据劳动法律法规，即使因公司自身原因导致员工无法正常工作（如存休期间），在一个工资支付周期内，公司也应当按照劳动合同规定的标准支付工资；超过一个工资支付周期的，若员工提供了正常劳动，支付给员工的劳动报酬不得低于当地的最低工资标准；若员工没有提供正常劳动，应按国家有关规定办理（一般支付一定的生活费）。如果公司在存休期间不支付工资或生活费，那么这种存休安排是不合法的。
存休的程序和要求
公司在安排员工存休前，应当提前与员工进行沟通，明确存休的原因、期限、工资待遇等事项，并尽量确保存休的公平性和合理性。同时，公司应当严格遵守相关法律法规，不得因员工拒绝存休而对其进行歧视或报复。
建议：如果公司提出存休安排，员工应首先与公司进行沟通协商，明确存休的具体条件和待遇。如果员工对存休安排有异议或认为公司存在违法行为，可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁来维护自己的权益。
总之，公司让员工存休的合法性取决于多种因素，包括双方是否协商一致、是否符合法律规定的加班时间限制、存休期间是否支付工资或生活费等。如果你对存休安排有疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。