企业要求全部工人签保密协议，若因此产生纠纷，是可以申请劳动仲裁的。以下从多个角度为你详细分析：

保密协议的合法性基础

根据《劳动合同法》的相关规定，用人单位与劳动者可以在劳动合同中约定保守用人单位的商业秘密和与知识产权相关的保密事项。这意味着，企业有权要求员工签订保密协议，以保护其商业秘密和知识产权。但这一权利并非无限制的，必须遵循合法、公平、平等自愿、协商一致、诚实信用的原则。

保密协议的签订条件

1. 内容合法：保密协议的内容必须合法，不得违反法律法规的强制性规定，也不得侵犯劳动者的合法权益。例如，保密协议中不得约定过高的违约金，或者要求劳动者承担不合理的保密义务。
2. 双方自愿：保密协议的签订必须是双方自愿的，企业不得强迫劳动者签订。如果企业以不签订保密协议就不录用、不续签劳动合同或者解除劳动合同等手段，强迫劳动者签订保密协议，那么该协议可能因违反自愿原则而被认定为无效。
3. 公平合理：保密协议应当公平合理，既要保护企业的商业秘密和知识产权，也要保障劳动者的合法权益。例如，保密协议可以约定劳动者在离职后的一定期限内不得从事与原企业相同或类似的业务，但这一期限应当合理，不得过长。

劳动仲裁的适用情况

如果企业要求全部工人签订保密协议，但存在以下情形之一，劳动者可以申请劳动仲裁：

1. 协议内容违法：如果保密协议的内容违反了法律法规的强制性规定，或者侵犯了劳动者的合法权益，劳动者可以申请劳动仲裁，要求确认协议无效或者撤销协议。
2. 企业强迫签订：如果企业以不签订保密协议就不录用、不续签劳动合同或者解除劳动合同等手段，强迫劳动者签订保密协议，劳动者可以申请劳动仲裁，要求企业承担违法解除劳动合同的法律责任。
3. 协议履行纠纷：如果双方在履行保密协议过程中发生纠纷，例如企业认为劳动者违反了保密义务，而劳动者则认为自己没有违反，双方无法协商一致的，劳动者也可以申请劳动仲裁，要求仲裁机构进行裁决。

劳动仲裁的流程与注意事项

1. 提交仲裁申请：劳动者需要向当地的劳动争议仲裁委员会提交仲裁申请，并附上相关证据材料。
2. 仲裁受理：仲裁委员会在收到申请后，会进行审查，如果认为符合受理条件，会受理案件并通知双方当事人。
3. 开庭审理：仲裁委员会会安排开庭审理，双方当事人需要出庭陈述自己的意见和提供证据。
4. 裁决：仲裁委员会在审理结束后，会根据事实和法律规定作出裁决。如果劳动者对裁决结果不服，还可以在法定期限内向人民法院提起诉讼。

建议：在签订保密协议前，劳动者应当仔细阅读协议内容，确保自己理解并同意其中的条款。如果对协议内容有疑问或者不满意，可以与企业进行协商修改。如果企业强迫签订或者协议内容违法，劳动者应当及时维护自己的合法权益，通过申请劳动仲裁等方式解决纠纷。

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