核心结论：因甲方提供低层房屋（可能指房屋价值低或支付能力不足）导致工程款不够支付农民工工资，可通过以下途径解决：
核查合同条款，明确支付责任
- 审查合同约定：首先需核查与甲方签订的工程承包合同，确认合同中关于工程款支付方式、支付时间、支付条件等具体条款。若合同中明确约定了甲方应支付的工程款金额及支付时间，而甲方未按约定支付，则甲方构成违约。
- 主张违约责任：根据《民法典》相关规定，当事人一方不履行合同义务或者履行合同义务不符合约定的，应当承担继续履行、采取补救措施或者赔偿损失等违约责任。因此，可要求甲方按照合同约定支付剩余工程款，并承担因违约造成的损失，包括但不限于农民工工资的差额部分。
利用法律途径，保障农民工权益
- 申请劳动仲裁或提起诉讼：若甲方拒绝支付或无力支付工程款，导致农民工工资无法按时足额发放，农民工或承包方可向当地劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁，要求甲方支付拖欠的工资。若对仲裁结果不服，还可向人民法院提起诉讼。
- 申请财产保全：在提起诉讼或仲裁前，为防止甲方转移财产，可向人民法院申请财产保全，冻结甲方的银行账户、房产等财产，确保判决或裁决能够得到有效执行。
寻求政府协助，利用行政手段
- 向劳动监察部门投诉：农民工或承包方可向当地劳动监察部门投诉甲方的违法行为，劳动监察部门有权对甲方进行调查，并责令其限期支付拖欠的工资。
- 申请政府垫付：在特定情况下，如甲方确实无力支付且符合相关条件，可向当地政府申请垫付农民工工资，后续再由政府向甲方追偿。
协商与调解，寻求和解途径
- 与甲方协商：在采取法律手段之前，可尝试与甲方进行协商，寻求和解途径。通过友好沟通，了解甲方的实际困难和支付意愿，争取达成双方都能接受的支付方案。
- 寻求第三方调解：若协商无果，可寻求第三方调解机构或行业协会的帮助，通过调解方式解决纠纷。调解具有灵活性和高效性，有助于快速解决争议，降低诉讼成本。