公司让身体有疾病的员工拿保底工资而不让上班，这一行为是否合法，需分情况讨论：

1. 若员工疾病属于工伤范畴：

   • 根据《工伤保险条例》的相关规定，员工因工作遭受事故伤害或者患职业病需要暂停工作接受工伤医疗的，在停工留薪期内，原工资福利待遇不变，由所在单位按月支付。这意味着，如果员工的疾病被认定为工伤，公司无权单方面决定让员工拿保底工资而不让上班，而应继续支付员工原工资福利待遇。
   • 若公司违反此规定，员工有权向劳动保障部门投诉，要求公司补发工资并可能获得相应的赔偿。

2. 若员工疾病不属于工伤范畴，但属于非因工负伤：

   • 根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》，企业职工因患病或非因工负伤，需要停止工作医疗时，根据本人实际参加工作年限和在本单位工作年限，给予三个月到二十四个月的医疗期。在医疗期内，企业不得解除劳动合同，并应按照规定支付病假工资或疾病救济费，这通常不会低于当地最低工资标准的80%。
   • 若公司仅支付保底工资且低于法定标准，则可能构成违法，员工有权要求公司补足差额。

3. 若员工疾病既不属于工伤也不属于非因工负伤，但公司出于人文关怀或内部规定让员工休息：

   • 在这种情况下，公司让员工拿保底工资而不让上班，虽然可能出于好意，但若保底工资低于当地最低工资标准或未与员工协商一致，则可能涉及违法。因为即使员工不上班，公司也应确保员工的基本生活需求，支付不低于最低工资标准的工资（除非法律另有规定或双方另有约定）。
   • 建议公司：在与员工协商一致的基础上，明确休息期间的工资待遇，并确保不低于法定标准。

4. 若公司无正当理由，单方面决定让员工拿保底工资而不让上班：

   • 这种行为可能构成对员工劳动权益的侵犯，员工有权向劳动保障部门投诉或提起劳动仲裁，要求公司恢复工作、补发工资并可能获得相应的赔偿。

法律建议：

• 对于员工而言，若遇到公司让拿保底工资而不让上班的情况，首先应了解自己的疾病是否属于工伤或非因工负伤范畴，并查阅相关法律法规，明确自己的权益。
• 若公司行为涉嫌违法，员工应与公司进行沟通协商，要求公司恢复工作或补发工资。若协商无果，员工可以向当地劳动保障部门投诉或提起劳动仲裁，维护自己的合法权益。
• 对于公司而言，应严格遵守相关法律法规，尊重员工的劳动权益，避免因违法操作而引发劳动纠纷。在处理员工疾病问题时，应与公司员工进行充分沟通，确保决策合法合规且合理。

可能后果：

• 若公司行为被认定为违法，可能面临劳动保障部门的处罚，包括但不限于罚款、责令改正等。
• 同时，公司还可能因违法操作而损害企业形象，影响员工士气和工作效率。

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