公司法人用微信支付工资在符合一定条件下是合法的，但需要注意相关的法律风险和合规问题。以下是对这一问题的详细分析：

1. 合法性分析：

   • 货币形式合规：根据《工资支付暂行规定》，工资应当以法定货币支付。微信中的资金作为电子数据形式的法定货币体现，从货币形式上并不违反该规定。因此，只要通过微信发放的工资是足额、按时的，并且符合其他劳动法律法规的要求，这种方式就是合法的。
   • 劳动者同意：公司使用微信支付工资还需经过劳动者的明确同意，这是确保双方就支付方式达成一致的重要前提。

2. 需要注意的问题与风险：

   • 举证困难：若双方未明确约定工资发放方式为微信转账，一旦发生争议，劳动者可能面临举证困难。因此，建议在劳动合同中明确约定工资支付方式及相关细节。
   • 记录有效性：微信转账记录易于删除或篡改，可能影响其作为法律证据的有效性。劳动者应妥善保存相关聊天记录、转账截图等证据。
   • 系统故障风险：微信作为第三方平台，可能存在系统故障或网络延迟等问题，导致工资未能按时发放或出现错误。公司应建立应急预案，确保在出现问题时能及时处理。
   • 税务风险：通过微信发放工资可能不利于税务监管，公司需确保按照法律规定代扣代缴员工的个人所得税，并进行正确的税务申报和缴纳。
   • 社保缴纳风险：社保缴费基数通常根据员工工资收入确定。使用微信支付工资可能使工资收入难以准确统计，从而影响社保的足额缴纳。

3. 合法合规性建议：

   • 明确合同约定：在签订劳动合同时，双方应明确约定工资支付方式（包括微信支付）、支付时间等关键条款。
   • 选择对公账户：为确保税收及社保的合理处理，公司应优先选择通过对公账户发放工资。若确实需要通过微信等电子支付方式发放工资，也应确保相关操作的合规性和可追溯性。
   • 加强监管与自查：公司应加强对工资发放方式的监管，定期进行自查，确保工资支付的合法性、合规性。

综上所述，公司法人用微信支付工资在双方协商一致、符合法律法规，并能确保工资支付记录的准确性和可追溯性的前提下是合法的。然而，由于存在多种潜在风险，公司应谨慎选择支付方式，并加强合规管理。如有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请随时向我提问。