企业申请破产时，与员工的劳动合同可以依法解除，但这一过程必须严格遵循法定程序和规定，以确保劳动者的合法权益得到充分保障。以下是对这一问题的详细解析：

一、法律依据

根据《中华人民共和国劳动合同法》第四十四条的规定，当用人单位被依法宣告破产时，劳动合同即行终止。这是企业破产解除职工劳动合同的法律基础。这意味着，一旦企业被法院依法宣告破产，其与员工之间的劳动合同将自动终止，无需双方再行协商解除。

二、解除程序与规定

1. 通知工会：企业在解除劳动合同前，应当事先将理由通知工会，并听取工会的意见。这是保障劳动者权益的重要环节，工会作为劳动者的代表，有权对解除劳动合同的合理性提出意见和建议。

2. 经济补偿：企业需要按照法律规定向职工支付经济补偿。补偿标准根据劳动者在本单位工作的年限计算，每满一年支付一个月工资；六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，支付半个月工资的经济补偿。对于月工资高于当地上年度职工月平均工资三倍的劳动者，补偿标准按职工月平均工资三倍的数额支付，但补偿年限最高不超过十二年。这里的“月工资”指的是劳动合同解除或终止前十二个月的平均工资。

3. 办理离职手续：企业应为职工办理离职相关手续，包括出具解除劳动合同的证明，并在十五日内为劳动者办理档案和社会保险关系转移手续。这是企业解除劳动合同后的法定义务，也是保障劳动者后续就业和社会保险权益的重要措施。

三、管理人的角色与职责

在破产清算过程中，管理人有权对破产申请受理前成立而债务人和对方当事人均未履行完毕的合同进行审查，并决定是否解除或继续履行。对于劳动合同，管理人同样有权根据具体情况决定是否解除，但必须确保劳动者的合法权益不受侵害。管理人在行使这一权力时，应当遵循公平、公正、公开的原则，确保解除劳动合同的决定合法、合理、合情。

四、劳动者的权益保护

劳动者在企业破产过程中并非完全被动。他们有权了解自己的权益和维权方式，如向劳动监察部门投诉、申请劳动仲裁或提起诉讼等。同时，企业和管理人在解除劳动合同时，应依法履行相关义务，确保劳动者的合法权益得到妥善保障。这包括但不限于支付经济补偿、办理离职手续等。

总结来说，企业申请破产时，与员工的劳动合同可以依法解除，但必须严格遵循法定程序和规定，确保劳动者的合法权益得到充分保障。劳动者也应了解自己的权益和维权方式，以便在必要时采取适当的行动来维护自己的合法权益。