在职能职责划转后，出让合同中的仲裁条款原则上由新的主体承继，但具体是否承继还需根据合同相对性原则、合同转让的法律规定以及仲裁条款的独立性原则来综合判断。以下是对这一问题的详细分析：
一、合同相对性原则与合同转让
合同相对性原则：合同是双方当事人之间设立、变更、终止民事关系的协议，其效力仅限于合同双方当事人。在出让合同中，原合同双方当事人约定的仲裁条款，原则上仅对原双方具有约束力。
合同转让：当合同的一方或双方将合同的权利义务全部或部分转让给第三人时，合同的内容（包括仲裁条款）是否随之转让，需根据合同转让的具体情况和法律规定来判断。在职能职责划转的情况下，如果原合同的一方（如政府部门或企业）将其职能职责划转给新的主体，且该划转涉及合同权利义务的转让，那么原合同中的仲裁条款是否由新主体承继，就需进一步分析。
二、仲裁条款的独立性原则
仲裁条款具有独立性，即仲裁条款的效力不受合同其他条款变更、解除或终止的影响。这意味着，即使合同的其他条款因职能职责划转而发生变化，仲裁条款的效力原则上仍应保持不变。然而，这种独立性并不意味着仲裁条款可以脱离合同整体而单独存在或转让。仲裁条款的承继仍需以合同权利义务的承继为前提。
三、具体判断标准
合同权利义务是否明确转让：如果职能职责划转明确涉及合同权利义务的转让，且新主体明确表示接受原合同中的所有条款（包括仲裁条款），那么仲裁条款应由新主体承继。
新主体是否成为合同当事人：仲裁条款的效力仅限于合同当事人之间。如果新主体因职能职责划转而成为原合同的当事人（如通过合同转让、合并、分立等方式），那么仲裁条款应对新主体具有约束力。
双方是否有明确约定：如果原合同双方或新主体在职能职责划转过程中就仲裁条款的承继问题有明确约定，那么应按照约定执行。
四、法律建议
审查合同条款：在职能职责划转前，应仔细审查原合同中的仲裁条款，明确其适用范围和效力。
明确约定承继问题：在职能职责划转过程中，双方应就仲裁条款的承继问题作出明确约定，以避免后续纠纷。
咨询专业律师：如果涉及复杂的合同转让或职能职责划转问题，建议咨询专业律师，以确保合同条款的合法性和有效性。
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