在机动车交通事故责任纠纷中，若原告全责，被告垫付的医疗费是否扣除，需分情况讨论：

1. 被告垫付医疗费基于法律义务或合同约定

   • 法律义务：若被告（如车主或驾驶员）因法律义务（如《道路交通安全法》规定的救助义务）先行垫付了医疗费，且后续被认定需承担赔偿责任（尽管原告全责，但可能存在特殊情形如被告存在过错或保险合同约定等），则该垫付费用通常会在最终赔偿中予以抵扣。这是因为被告的垫付行为实质上是在履行其可能承担的赔偿责任，故在最终结算时需进行相应扣减。
   • 合同约定：若被告与原告或保险公司之间存在合同关系（如保险合同），且合同中明确约定了被告垫付医疗费的后续处理方式（如抵扣赔偿款等），则应按照合同约定执行。这种情况下，被告垫付的医疗费同样会在最终赔偿中予以扣除。

2. 被告垫付医疗费出于人道主义或自愿

   • 无后续赔偿义务：若被告垫付医疗费纯粹出于人道主义考虑或自愿行为，且后续被认定无需承担任何赔偿责任（即原告全责且被告无过错），则被告垫付的医疗费通常不会从原告的赔偿中扣除。但被告有权要求原告返还其垫付的费用，这可能通过另行起诉或协商解决。
   • 保险理赔情况：若被告垫付了医疗费，且该费用属于保险理赔范围（如被告购买了交强险或商业险），则被告可以向保险公司申请理赔。在理赔过程中，保险公司会根据保险合同和法律规定，对被告垫付的费用进行审核和赔付。若保险公司同意赔付，则被告垫付的费用实际上得到了补偿，无需再从原告的赔偿中扣除。但需注意，若保险公司赔付金额不足或拒绝赔付，被告仍可能需通过其他途径（如起诉原告）来追回其垫付的费用。

法律建议：

• 对于被告而言，在垫付医疗费前，应尽可能了解自身的法律义务和合同约定，以明确垫付费用的后续处理方式。同时，保留好所有垫付费用的相关证据（如收据、转账记录等），以便在后续处理中提供证明。
• 对于原告而言，若被告垫付了医疗费且后续被认定无需承担赔偿责任，应主动与被告协商返还垫付费用的事宜，以避免不必要的法律纠纷。
• 在处理此类纠纷时，建议双方尽量通过协商或调解方式解决争议，以节省时间和成本。若协商或调解无果，则可依法向人民法院提起诉讼或申请仲裁解决。

可能法律后果：

• 若被告垫付医疗费后未得到合理处理（如未抵扣赔偿款或未得到返还），则可能引发新的法律纠纷，导致双方进一步耗费时间和精力。
• 若原告在获得赔偿后未返还被告垫付的费用（在被告无需承担赔偿责任的情况下），则可能构成不当得利，被告有权要求原告返还并可能通过法律途径追讨。