结论前置：一个月工资3000元，请了三天假扣900多元，这个扣款金额是否合理，需要分情况讨论，一般情况下，若按照正常请假制度扣款，此金额可能不合理；若存在特殊情况，如请假导致公司重大损失或违反特殊约定等，则可能合理。以下为详细分析：
一、正常请假制度下的扣款情况
日工资计算：
- 根据常规计算方式，日工资 = 月工资 / 月计薪天数。月计薪天数通常按照21.75天计算（这是根据《关于职工全年月平均工作时间和工资折算问题的通知》得出的，即月计薪天数＝（365天-104天休息日）÷12月＝21.75天）。
- 因此，日工资 = 3000元 / 21.75天 ≈ 137.93元。
请假扣款计算：
- 若按照日工资计算请假扣款，三天假应扣款 = 137.93元/天 × 3天 = 413.79元。
- 显然，扣900多元远超过了按照日工资计算的扣款金额，在正常情况下，这种扣款方式是不合理的。
可能的不合理原因：
- 公司可能采用了不合理的扣款标准，如按照更高比例的日工资扣款，或者将其他费用（如全勤奖、绩效奖等）也一并扣除。
- 公司可能存在对请假制度的误解或错误执行，导致扣款金额过高。
二、特殊情况下的扣款情况
公司规章制度或劳动合同中的特殊约定：
- 如果公司规章制度或劳动合同中明确规定了请假扣款的特殊标准，且该标准不违反法律法规的强制性规定，那么按照该标准扣款可能是合理的。
- 例如，某些公司可能规定，请假超过一定天数后，将按照更高比例的日工资扣款，或者扣除其他相关费用。
请假导致公司重大损失：
- 如果员工请假导致公司遭受了重大损失，且该损失与员工的请假行为有直接因果关系，那么公司可能要求员工承担部分或全部损失。
- 在这种情况下，扣款金额可能超过按照日工资计算的金额，但具体是否合理需要根据损失情况、员工过错程度等因素进行综合判断。
员工违反特殊约定或承诺：
- 如果员工在入职时或请假前与公司有特殊约定或承诺，如承诺不请假、请假需提前通知等，且员工违反了这些约定或承诺，那么公司可能根据约定或承诺对员工进行扣款。
三、建议与行动
核查公司规章制度和劳动合同：
- 员工应首先核查公司的规章制度和劳动合同，了解请假扣款的具体标准和规定。
与公司沟通协商：
- 如果认为扣款金额不合理，员工可以与公司进行沟通协商，要求公司解释扣款原因和依据，并寻求合理的解决方案。
寻求法律援助：
- 如果沟通协商无果，员工可以寻求法律援助或咨询专业律师，了解自己的权益和维权途径。
最后，作为李现益律师，我擅长处理工伤赔偿、劳动仲裁、劳动纠纷、劳动合同等领域的问题。如果您有任何相关疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。