运输服务部个体户开具的物流费发票，在符合法定条件的情况下是合法的。以下从多个角度详细分析：

1. 主体资格角度
   根据《中华人民共和国发票管理办法》第十九条，销售商品、提供服务以及从事其他经营活动的单位和个人，对外发生经营业务收取款项，收款方应当向付款方开具发票。运输服务部作为个体工商户，若已依法办理税务登记并领取发票，即具备开具物流费发票的主体资格。但需注意：若未办理税务登记或未领取发票，则无权自行开具，需向税务机关申请代开。

2. 发票内容真实性角度
   发票的合法性要求内容真实、项目完整。运输服务部开具的物流费发票，必须与实际提供的运输服务内容一致，包括运输路线、货物名称、重量、运费金额等。若虚构业务或虚开发票（如无实际运输行为却开具发票），则构成违法行为，可能面临税务处罚甚至刑事责任。

3. 发票形式合规性角度
   根据《增值税发票开具指南》，运输服务部开具发票时需使用税务机关监制的发票，并按照规定的时限、顺序、栏目，全部联次一次性如实开具。若使用非法定发票（如自制收据）或未按规定填写（如未填写纳税人识别号、项目名称错误等），则发票不合法。

4. 税务合规性角度
   运输服务部需按实际收入申报纳税。若开具发票后未依法纳税（如隐瞒收入、少缴税款），则税务机关可追缴税款、加收滞纳金，并处以罚款。此外，若个体户选择按小规模纳税人纳税，需注意增值税起征点政策（如月销售额未超过10万元可免征增值税），但开具发票后仍需按规定申报。

建议：

• 若您是运输服务部个体户，开具发票前需确保已办理税务登记、领取合法发票，并如实填写内容、依法纳税。
  
• 若您是收票方，需核对发票内容与实际业务是否一致，并要求对方提供税务登记证明，以降低税务风险。
  

如有进一步疑问，可直接向我咨询，我会结合具体场景为您详细解答。