结论：政府采购项目招标文件中无付款方式，而在合同中约定付款方式，这种做法本身并不直接违反法律法规的强制性规定，但可能因不符合政府采购的相关要求或导致合同条款不明确而引发合规风险或合同纠纷。以下从不同角度进行详细分析：
一、法律法规层面
政府采购法相关规定：
- 根据《中华人民共和国政府采购法》及其相关规定，政府采购项目应当遵循公开透明、公平竞争、公正和诚实信用的原则。虽然法律并未明确规定招标文件中必须包含付款方式，但招标文件作为政府采购活动的重要文件，应当尽可能详细、明确地描述采购需求，包括付款方式等关键条款，以确保供应商能够充分理解并作出响应。
合同法相关规定：
- 根据《中华人民共和国民法典》合同编的规定，合同是双方意思表示一致的协议，合同内容应当明确、具体。付款方式作为合同的重要条款之一，应当在合同中明确约定。如果招标文件中未约定付款方式，而在合同中约定，这并不违反合同法的强制性规定，但前提是双方能够就付款方式达成一致，并且该约定不违反法律法规的强制性规定。
二、合规风险层面
政府采购合规性：
- 政府采购项目通常受到较为严格的监管，包括招标文件的编制、发布、评审等环节。如果招标文件中未包含付款方式等关键条款，可能被视为招标文件编制不完整或存在瑕疵，从而引发合规风险。此外，如果合同中的付款方式与政府采购的相关要求不符，也可能导致合同无效或被撤销。
合同条款明确性：
- 付款方式是合同中的重要条款之一，它直接关系到双方的权益和义务。如果招标文件中未约定付款方式，而在合同中约定，虽然不违反法律法规的强制性规定，但可能因双方对付款方式的理解不一致或约定不明确而引发合同纠纷。因此，为了确保合同的明确性和可执行性，建议在招标文件中就付款方式等关键条款进行明确约定。
三、实践建议
完善招标文件：
- 在编制政府采购项目招标文件时，应当尽可能详细、明确地描述采购需求，包括付款方式等关键条款。这有助于供应商充分理解采购需求并作出响应，同时也有助于减少后续合同纠纷的风险。
明确合同条款：
- 在签订合同时，双方应当就付款方式等关键条款进行明确约定，并确保约定内容符合法律法规的强制性规定和政府采购的相关要求。如果招标文件中未约定付款方式，双方应当在合同中就付款方式进行详细、明确的约定，以避免后续纠纷。
加强沟通与协商：
- 在政府采购项目中，采购人和供应商应当加强沟通与协商，就付款方式等关键条款达成一致意见。这有助于确保合同的顺利履行和双方权益的保障。
如有任何关于政府采购项目或合同纠纷的法律问题，可以直接向我咨询。