结论：工业用地能否合法盖超市，需根据土地用途规划、是否经过合法变更手续以及是否符合相关法律法规来综合判断。一般情况下，若未经过合法变更手续，直接在工业用地上盖超市是不合法的。以下从不同角度进行详细分析：
一、土地用途规划的角度
根据《中华人民共和国土地管理法》及相关规定，土地用途分为农用地、建设用地和未利用地，其中建设用地又包括居住用地、公共管理与公共服务用地、商业服务业设施用地、工业用地等。每种土地用途都有其特定的使用范围和限制。工业用地，顾名思义，是用于工业生产、仓储等活动的土地，其用途具有特定性。
若要在工业用地上盖超市，首先需确认该土地是否已被规划为商业服务业设施用地或允许兼容商业用途。如果土地用途规划中并未包含商业用途，那么直接在该土地上盖超市将违反土地用途规划，属于违法行为。
二、土地用途变更的角度
如果工业用地确实需要用于商业用途，如盖超市，那么必须按照法定程序进行土地用途变更。这通常包括以下几个步骤：
只有经过上述合法变更手续后，工业用地才能用于盖超市。否则，即使土地使用者自行在工业用地上盖了超市，也将面临被认定为违法建筑、被责令拆除或罚款等法律风险。
三、相关法律法规的角度
除了土地用途规划和变更手续外，还需考虑其他相关法律法规的规定。例如，根据《中华人民共和国城乡规划法》的规定，建设单位或者个人在进行建设活动时，必须取得建设工程规划许可证。如果未经许可擅自进行建设活动，将面临被责令停止建设、限期拆除或罚款等法律后果。
四、实际案例与风险
在实际操作中，因未经合法变更手续而在工业用地上盖超市而引发的法律纠纷并不少见。这些纠纷往往涉及土地用途规划、土地使用权出让合同、建设工程规划许可等多个方面。一旦被认定为违法建筑或违规建设，不仅可能面临被拆除的风险，还可能承担因此产生的经济损失和法律责任。
建议：如果您有在工业用地上盖超市的打算，务必先确认土地用途规划是否允许商业用途，并按照法定程序进行土地用途变更和办理相关手续。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。