结论：事业单位退休工人退休3年后能否在本行业担任专职秘书长，需结合该事业单位性质、退休人员原职务级别、单位规章制度以及相关法律法规综合判断，以下分情况说明：
一、事业单位性质与退休人员原职务级别的影响
公益一类事业单位：
- 此类单位通常承担基础性、公益性服务职能，如教育、医疗等。退休人员若原职务涉及重要管理或专业技术岗位，其退休后可能受到一定限制，尤其是涉及利益冲突或保密要求的岗位。
- 若原职务不涉及敏感领域：退休3年后，在符合单位规章制度的前提下，担任专职秘书长可能不被禁止，但需确保不违反单位关于退休人员兼职或任职的相关规定。
公益二类及经营类事业单位：
- 此类单位可能涉及一定的市场竞争或经营行为。退休人员若原职务与市场竞争或经营相关，其退休后任职可能受到更严格的限制，以防止利益输送或不当竞争。
- 若原职务与市场竞争无直接关联：且退休后任职不违反单位规章制度，担任专职秘书长可能具有可行性。
二、单位规章制度的具体要求
- 单位明确禁止退休人员任职：若事业单位有明确规定禁止退休人员在一定期限内（如退休后3年内）在本行业或本单位担任特定职务，则退休工人需遵守此规定，不得担任专职秘书长。
- 单位无明确禁止或限制：若单位规章制度未对退休人员任职作出明确限制，或退休3年后已解除相关限制，则退休工人在符合其他条件（如年龄、健康状况等）的前提下，可考虑担任专职秘书长。
三、相关法律法规的考量
- 《公务员法》及事业单位人员管理规定：虽然事业单位人员不直接适用《公务员法》，但部分事业单位可能参照公务员管理或制定类似规定。若退休人员原职务级别较高，可能受到更严格的任职限制。
- 《劳动法》与《劳动合同法》：这两部法律主要规范在职员工的劳动关系，对退休人员任职的直接限制较少。但退休人员任职需确保不违反与原单位签订的竞业限制协议（如有）或其他相关约定。
- 行业自律规范：某些行业可能存在自律规范或行业协会章程，对退休人员任职作出限制或要求。退休工人在担任专职秘书长前，需了解并遵守相关行业规范。
四、实际操作建议
- 咨询原单位人事部门：了解单位对退休人员任职的具体规定和要求，确保任职行为符合单位规章制度。
- 审查竞业限制协议：若与原单位签订过竞业限制协议，需仔细审查协议内容，确保任职行为不违反协议约定。
- 考虑利益冲突与保密要求：确保任职行为不会引发利益冲突或违反保密义务，维护个人及原单位的声誉和利益。
总结：事业单位退休工人退休3年后能否在本行业担任专职秘书长，需综合考虑事业单位性质、退休人员原职务级别、单位规章制度以及相关法律法规等多方面因素。在符合所有条件的前提下，退休工人可考虑担任专职秘书长，但务必确保任职行为合法合规，避免引发不必要的法律纠纷。如有任何疑问或需要进一步法律帮助，请直接向我咨询。