退休干部不满三年能否担任协会秘书长，需结合协会性质及相关规定综合判断。以下从不同角度进行分析：
一、协会性质与规定
社会团体（如行业协会、商会等）：
- 一般规定：社会团体通常依据其章程进行管理，对于担任秘书长等职务的资格，章程中会有明确规定。若章程未明确禁止退休干部不满三年担任秘书长，且该退休干部符合其他任职条件（如具备相应的工作经验、管理能力等），则理论上可以担任。
- 特殊规定：某些特定类型的社会团体，如涉及国家安全、机密或需要特定资质的社会团体，可能对任职人员有更严格的限制，包括退休时间、政治背景等。此时，需具体查阅该社会团体的章程或相关管理规定。
民办非企业单位：
- 民办非企业单位同样依据其章程进行管理。对于退休干部担任秘书长的资格，也需参照章程中的相关规定。若章程无特殊限制，且退休干部符合其他任职条件，则可以担任。
基金会：
- 基金会的管理同样遵循其章程。对于秘书长的任职，基金会章程中会有明确规定。退休干部是否可以担任，需根据章程内容判断。
二、法律法规与政策
公务员法及相关规定：
- 若退休干部原为公务员，需关注《公务员法》及相关规定中关于退休后从业的限制。一般来说，公务员退休后，原系领导成员的公务员在离职三年内，其他公务员在离职两年内，不得到与原工作业务直接相关的企业或者其他营利性组织任职，不得从事与原工作业务直接相关的营利性活动。但此规定主要针对公务员退休后到企业或营利性组织任职的情况，对于到社会团体、民办非企业单位或基金会等非营利性组织任职，通常无直接限制。
地方性法规与政策：
- 某些地区可能出台了关于退休干部从业的具体规定或政策，包括到非营利性组织任职的限制。因此，在判断退休干部能否担任协会秘书长时，还需考虑当地的具体规定。
三、实际操作建议
查阅协会章程：
- 首先，应查阅目标协会的章程，了解其中关于秘书长任职资格的具体规定。
咨询相关部门：
- 若章程中无明确规定或存在模糊地带，建议咨询当地民政部门或相关行业协会管理部门，以获取更具体的指导。
考虑个人情况与协会需求：
- 退休干部在考虑担任协会秘书长时，还需结合自身情况（如健康状况、时间安排等）和协会的实际需求（如管理经验、行业资源等）进行综合判断。
总结：退休干部不满三年能否担任协会秘书长，并无统一的答案，而是需根据协会的性质、章程规定、相关法律法规及政策以及个人情况与协会需求等多方面因素进行综合判断。如有具体疑问或需要进一步的法律指导，请直接向我咨询。