结论前置：在对方车辆全责但挂靠公司不盖章的情况下，保险公司能否出具保函需分情况讨论，具体如下：

1. 保函的性质与出具条件
   保函是保险公司基于保险合同向第三方（如法院、受益人）出具的书面担保，承诺在特定条件下承担赔偿责任。其核心条件是保险合同已生效且责任明确，而非依赖挂靠公司的盖章。若对方车辆已投保且事故责任清晰（如交警认定全责），保险公司原则上可独立出具保函，无需挂靠公司额外盖章。

2. 挂靠公司不盖章的影响
   挂靠公司作为车辆名义所有人，若未在保险合同中作为被保险人或受益人，其盖章通常非保函出具的必要条件。但需注意：

   • 若保险合同约定“需挂靠公司确认责任”或类似条款，则可能影响保函出具；
     
   • 若挂靠公司拒绝配合（如拒绝提供车辆证件、保险单等材料），可能间接导致保险公司无法核实信息，从而拒绝出具保函。此时需通过法律途径（如起诉挂靠公司配合或直接向责任方索赔）解决。

3. 实务建议

   • 核实保险合同：要求对方或其保险公司提供保险单，确认被保险人、受益人及保函出具条件；
     
   • 固定证据：保存交警责任认定书、事故现场照片、对方车辆信息等，证明责任归属；
     
   • 协商或诉讼：若保险公司以挂靠公司未盖章为由拒绝出具保函，可主张保险合同独立性，要求其履行义务；或直接起诉对方车主、挂靠公司及保险公司，要求连带赔偿。

总结：挂靠公司不盖章本身不必然导致保险公司无法出具保函，需结合保险合同条款、责任认定情况综合判断。若遇阻碍，建议通过法律途径维护权益。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体操作流程。