结论前置：公司规定做不满1年要扣500元，这一做法是否合理，需分情况讨论，一般情况下是不合理的，但若该扣除与员工给公司造成的实际损失相关且合理，则可能被认定为合理。以下从不同角度进行分析：
一、从劳动合同法的角度
根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位与劳动者订立、履行、变更、解除或者终止劳动合同，应当遵循合法、公平、平等自愿、协商一致、诚实信用的原则。同时，该法也明确规定了用人单位不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。
若公司扣除的500元并非基于员工给公司造成的实际损失，而是作为一种惩罚性措施：
- 这种做法违反了劳动合同法的公平原则，因为员工并未因自身过错给公司造成实际损失，公司无权对其进行经济处罚。
- 在这种情况下，员工有权向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，要求公司返还被扣除的工资。
若公司扣除的500元是基于员工给公司造成的实际损失，且该损失与员工的工作行为直接相关：
- 根据《工资支付暂行规定》第十六条，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除，但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。
- 在这种情况下，如果公司能够证明员工确实给公司造成了实际损失，并且扣除的500元与损失金额相当且合理，那么这种扣除可能是合法的。但公司仍需确保扣除后的员工工资不低于当地最低工资标准。
二、从实际操作和合理性的角度
公司规章制度的合法性：
- 公司的规章制度应当经过民主程序制定，并且内容合法、合理。如果公司规章制度中明确规定了做不满一定年限要扣除一定金额的工资，但这一规定并未经过民主程序制定，或者内容违反了法律法规的强制性规定，那么这一规定是无效的。
- 员工有权拒绝执行无效的规章制度，并可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，要求公司返还被扣除的工资。
扣除金额的合理性：
- 即使公司规章制度中规定了扣除工资的情况，扣除的金额也应当合理。如果扣除的金额过高，超出了员工能够承受的范围，或者与员工给公司造成的实际损失不相符，那么这种扣除也是不合理的。
- 在这种情况下，员工同样有权向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，要求公司返还被不合理扣除的工资。
建议：如果你遇到了公司规定做不满1年要扣500元的情况，你可以先查看公司的规章制度是否合法、合理，并确认扣除的金额是否与你的实际损失相符。如果认为公司的做法不合理，你可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，维护自己的合法权益。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。