在存在事实劳动关系的主体合并重组消失的情况下，确认劳动关系主要可以通过以下几种途径：
依据合并重组的相关文件与公告：
- 当企业发生合并或重组时，通常会发布相关的公告或文件，明确合并或重组后的企业主体、债权债务承接情况等。这些文件是确认劳动关系的重要依据。劳动者可以查找并保存这些公告或文件，以证明自己与原企业存在劳动关系，且该劳动关系已由合并或重组后的企业承接。
通过工资支付记录、社保缴纳记录等证据：
- 工资支付记录、社保缴纳记录等是证明劳动关系存在的直接证据。即使企业发生合并或重组，这些记录通常也会由新的企业主体继续承接或延续。劳动者可以收集这些证据，以证明自己与合并或重组后的企业存在劳动关系。
依据劳动合同或相关协议：
- 如果劳动者与原企业签订了劳动合同或相关协议，且这些合同或协议中明确约定了劳动关系的承接或转移条款，那么劳动者可以依据这些合同或协议来确认自己与合并或重组后的企业的劳动关系。
通过劳动仲裁或诉讼途径：
- 如果劳动者与合并或重组后的企业在劳动关系确认问题上存在争议，且无法通过协商、调解等方式解决，那么劳动者可以向劳动仲裁机构申请劳动仲裁，或者向人民法院提起诉讼。在仲裁或诉讼过程中，劳动者需要提供充分的证据来证明自己与合并或重组后的企业存在劳动关系。
在具体操作时，劳动者需要注意以下几点：
- 及时收集证据：在企业发生合并或重组时，劳动者应及时收集与劳动关系相关的证据，如工资支付记录、社保缴纳记录、劳动合同等，以备不时之需。
- 关注企业公告与文件：劳动者应密切关注企业发布的合并或重组公告与文件，了解合并或重组后的企业主体、债权债务承接情况等，以便及时确认自己的劳动关系。
- 积极维护自身权益：如果劳动者在劳动关系确认问题上遇到困难或争议，应积极与企业沟通协商，或者寻求法律援助、劳动仲裁等途径来维护自身权益。
若企业合并重组后，原劳动合同继续有效，但用人单位发生变化的法律后果：
根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十四条的规定，用人单位发生合并或者分立等情况，原劳动合同继续有效，劳动合同由承继其权利和义务的用人单位继续履行。这意味着，即使企业发生合并或重组，劳动者的劳动关系也不会因此自动终止或解除，而是由合并或重组后的企业继续承接和履行原劳动合同。因此，劳动者在确认劳动关系时，也可以依据这一法律规定来主张自己的权益。
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