要让一个员工停薪留职且不违法，关键在于确保整个过程符合相关法律法规，并且经过双方的充分协商一致。以下是一些详细的步骤和建议，帮助您合法地进行停薪留职的安排：
一、协商一致
充分沟通：
- 与员工进行面对面的沟通，解释公司当前面临的困境或需要调整的原因，如经营困难、业务调整等。
- 倾听员工的意见和担忧，确保双方对停薪留职有共同的理解。
达成一致意见：
- 在沟通的基础上，双方应自愿达成一致意见，同意进行停薪留职。
- 强调停薪留职是暂时的，且公司会尽力在条件改善后恢复员工的正常工作和薪资。
二、明确约定
书面协议：
- 制定一份详细的书面协议，明确停薪留职的期限、双方的权利义务、社保缴纳等关键事项。
- 协议应由双方签字确认，以确保其法律效力。
保留证据：
- 保留好与员工沟通的记录、书面协议等证据，以备不时之需。
三、符合内部规章制度
制定合法规章制度：
- 如果公司内部有关于停薪留职的规章制度，应确保其制定程序合法，如经过民主程序制定、向劳动者公示等。
- 规章制度应明确停薪留职的申请流程、审批程序等，确保程序的合规性。
员工申请与批准：
- 员工应按照规章制度规定的流程申请停薪留职，并获得公司的批准。
四、确保劳动关系存续
- 即使员工停薪留职，其与用人单位之间的劳动关系仍然存续，受《劳动法》保护。
- 公司应继续为员工缴纳社会保险（除非双方另有约定且符合法律法规规定），以确保员工的权益不受损害。
五、避免违法情形
未经协商擅自决定：
- 切勿未经与员工协商，单方强制要求员工停薪留职，这侵犯了员工的合法权益，属于违法行为。
违反法律法规强制性规定：
- 在停薪留职期间，不得停止为员工缴纳社会保险（除非符合法律法规的例外情况）。
- 遵守其他所有相关的法律法规强制性规定，确保停薪留职的合法性。
避免不合理安排：
- 停薪留职期限应合理，且不得过长。
- 在停薪留职期满后，应欢迎员工返岗，并为其提供正常的工作条件和薪资。
六、合法解决方案建议
- 如果公司面临经营困难或其他需要调整员工工作的情况，除了停薪留职外，还可以考虑其他合法且人性化的解决方案，如调整工作安排、减少工作时间、降低工资等。
- 这些方案应在与员工充分沟通、协商一致的基础上进行，并确保符合法律法规的规定。
七、维权途径提示
- 如果员工认为公司的停薪留职安排侵犯了其合法权益，应先与公司进行沟通协商。
- 协商不成的，员工可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁来维护自己的权益。
综上所述，要让一个员工停薪留职且不违法，关键在于确保双方协商一致、明确约定、符合内部规章制度、确保劳动关系存续，并避免任何违法情形。同时，公司应考虑提供合法且人性化的解决方案，以维护和谐稳定的劳动关系。