公司让停薪留职是否违法，需结合具体情况来判断。以下是从不同角度进行的详细分析：
合法情形
协商一致且有明确约定：
- 如果公司与员工就停薪留职事宜进行了充分沟通和协商，双方自愿达成一致意见，并通过书面协议等形式明确约定了停薪留职的期限、双方权利义务等内容，那么这种停薪留职是合法的。例如，公司因经营困难进行业务调整，与员工协商停薪留职，并在协议中约定保留社保缴纳等事项，这种情况下停薪留职是合法的。
符合内部规章制度：
- 如果公司内部有关于停薪留职的合法规章制度，且该规章制度的制定程序合法（如经过民主程序制定、向劳动者公示等），员工按照规章制度规定的流程申请并获得批准后进行停薪留职，那么这种停薪留职也是合法的。
劳动关系存续：
- 即使员工停薪留职，其与公司之间的劳动关系仍然存续，受《劳动法》保护。只要公司没有违反法律法规的强制性规定，且双方有明确的约定或符合内部规章制度，停薪留职就不违法。
违法情形
未经协商擅自决定：
- 如果公司未与员工协商，单方强制要求员工停薪留职，这侵犯了员工的合法权益，属于违法行为。员工有权拒绝这种安排，并要求公司继续履行原劳动合同或支付因违法停薪留职造成的经济损失。
违反法律法规强制性规定：
- 在停薪留职期间，如果公司停止为员工缴纳社会保险，这违反了《社会保险法》的强制性规定，属于违法行为。此外，其他任何违反法律法规强制性规定的停薪留职行为，也均属违法。
损害劳动者权益的不合理安排：
- 如果停薪留职期限过长且不合理，或在停薪留职期满后拒绝员工返岗要求等情况，也可能涉嫌违法。这些行为都损害了员工的合法权益，员工有权通过法律途径来维护自己的权益。
法律建议
- 与公司沟通协商：如果公司提出停薪留职的要求，员工应首先与公司进行友好沟通和协商，了解停薪留职的原因和意图，并尝试寻求双方都能接受的解决方案。
- 保留证据：在整个沟通过程中，员工应妥善保留与公司的所有相关证据，包括劳动合同、工资单、停薪留职通知、沟通记录等，以备后续争议解决之需。
- 寻求法律途径：如果沟通协商无果，员工可以向当地劳动保障监察机构举报投诉，要求其对公司的不当行为进行监督检查并责令改正。如问题仍未解决，员工可向劳动争议仲裁委员会提交仲裁申请，要求公司继续履行劳动合同、支付拖欠工资及经济损失。在必要时，员工还可通过司法诉讼程序进一步寻求解决方案。
总结来说，公司让停薪留职是否违法，取决于是否符合相关法律法规规定且经过双方协商一致。如果公司未经协商擅自决定停薪留职，或违反法律法规强制性规定，或损害劳动者权益，那么这种行为就是违法的。员工在面对这种情况时，应积极采取相应措施维护自己的合法权益。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。