在民用工程鉴定有合同的情况下，法院不一定会直接按照市场价进行鉴定，而是会综合考虑多种因素来确定鉴定依据。以下是对这一问题的详细分析：

一、合同约定优先原则

1. 合同内容：如果合同中明确约定了工程鉴定的价格标准或方法，那么法院在审理案件时，通常会优先遵循合同中的约定。这是因为合同是双方当事人意思自治的体现，具有法律约束力。
2. 例外情况：当然，如果合同中的约定存在违法、显失公平或无法履行等情形，法院可能会根据相关法律法规或公平原则进行调整。

二、市场价鉴定的适用条件

1. 合同无约定或约定不明：如果合同中没有明确约定工程鉴定的价格标准或方法，或者约定不明确导致无法执行，那么法院可能会考虑采用市场价进行鉴定。市场价作为客观、公正的价格标准，有助于确保鉴定结果的合理性和公正性。
2. 双方协商一致：即使合同中有约定，但如果双方当事人在诉讼过程中协商一致，同意采用市场价进行鉴定，法院也会尊重双方的意愿，并据此进行鉴定。

三、法院综合考量因素

1. 工程实际情况：法院在决定是否采用市场价进行鉴定时，会充分考虑工程的实际情况，包括工程的性质、规模、复杂程度等。这些因素可能影响鉴定的难度和成本，从而影响鉴定价格的选择。
2. 公平原则：法院在审理案件时，会遵循公平原则，确保双方当事人的合法权益得到平等保护。如果采用市场价进行鉴定更符合公平原则的要求，法院可能会倾向于选择市场价。
3. 鉴定机构的意见：法院在委托鉴定机构进行鉴定时，会要求鉴定机构根据专业知识和经验，提出合理的鉴定意见。鉴定机构的意见也是法院决定是否采用市场价进行鉴定的重要参考。

四、实际操作建议

1. 完善合同条款：为了避免在诉讼过程中因鉴定价格问题产生争议，建议在签订合同时，明确约定工程鉴定的价格标准或方法。这样可以在争议发生时，为法院提供明确的裁判依据。
2. 积极协商：如果合同中没有约定或约定不明，双方当事人在诉讼过程中应积极协商，寻求共识。通过协商达成一致意见，可以减少诉讼成本和时间，提高诉讼效率。
3. 寻求专业帮助：在涉及工程鉴定的问题上，建议双方当事人寻求专业律师或鉴定机构的帮助。他们可以提供专业的法律意见和鉴定服务，帮助当事人更好地维护自己的合法权益。

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