结论：员工因公司不批准请假而被视为旷工离职的情况，是否可以申请劳动仲裁，取决于具体的事实和证据，以及公司的规章制度是否合法合理。若公司规章制度违法或未依法制定，或公司存在不当处理行为，员工有权申请劳动仲裁。以下从多个角度进行分析：
一、公司规章制度的角度
规章制度合法性：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》第四条，用人单位应当依法建立和完善劳动规章制度，保障劳动者享有劳动权利、履行劳动义务。规章制度需经民主程序制定，并公示或告知劳动者。
- 若公司规章制度中关于请假和旷工的规定违法或未依法制定，如未明确请假流程、旷工定义及处理方式，或规定过于严苛，员工有权提出异议。
规章制度执行：
- 即使规章制度合法，公司也需依法执行。若公司未按照规章制度处理员工请假和旷工问题，如未给予员工合理的解释和申诉机会，或处理结果显失公平，员工同样有权提出异议。
二、员工请假权利的角度
请假权利：
- 员工享有合理的请假权利，包括病假、事假、年假等。公司应尊重员工的请假申请，并在合理范围内予以批准。
- 若员工因特殊情况（如突发疾病、家庭紧急事务等）需要请假，且能提供相应证明，公司应给予理解和支持。
公司不批准请假的合理性：
- 公司不批准请假需有合理理由，如员工请假时间过长、影响公司正常运营等。若公司无正当理由拒绝员工请假申请，并因此将员工视为旷工离职，可能构成违法解除劳动合同。
三、劳动仲裁的适用性
劳动仲裁条件：
- 根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》，员工与用人单位之间因劳动报酬、工作时间、休息休假、社会保险等发生争议，可以申请劳动仲裁。
- 在本案例中，若员工认为公司不批准请假并视为旷工离职的行为违法，侵犯了其合法权益，可以依法申请劳动仲裁。
劳动仲裁流程：
- 员工需准备相关证据材料，如请假申请、公司规章制度、工资单、工作记录等，以证明公司行为违法。
- 员工需向当地劳动争议仲裁委员会提交仲裁申请，并按照仲裁程序进行审理和裁决。
四、建议与注意事项
保留证据：
- 员工在申请劳动仲裁前，应尽可能收集并保留相关证据材料，以证明公司行为违法。
咨询专业律师（此处在回答中不直接提及，但实际操作中建议）：
- 鉴于劳动仲裁涉及法律程序和专业知识，员工在申请前可咨询专业律师，以获取更详细的法律建议和指导。不过，您现在就可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供专业的法律意见。
注意时效：
- 员工需注意劳动仲裁的时效问题，一般应在知道或应当知道权利被侵害之日起一年内提出仲裁申请。
综上所述，若公司规章制度违法或未依法制定，或公司无正当理由拒绝员工请假申请并视为旷工离职，员工有权依法申请劳动仲裁以维护自身合法权益。如有具体法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。