停工留薪工资确实包括治疗期间的工资。以下是对这一问题的详细分析：
一、法律依据
根据《工伤保险条例》第三十三条的明确规定，职工因工作遭受事故伤害或者患职业病需要暂停工作接受工伤医疗的，在停工留薪期内，原工资福利待遇不变，由所在单位按月支付。这一规定直接回答了您的问题，即停工留薪期间的工资是包括治疗期间的工资的，且工资福利待遇应保持不变。
二、工资构成与发放
工资构成：停工留薪期间的工资应包含职工正常工作时的全部收入和福利，这包括但不限于基本工资、绩效工资、奖金、津贴等。绩效工资作为工资构成的一部分，在停工留薪期也应继续支付，以保障工伤职工在治疗康复期间的生活水平不降低。
发放时间与方式：停工留薪期工资由所在单位按月支付，确保职工在停工留薪期间的基本生活需求得到满足。用人单位不得因职工未提供劳动而拒绝支付或拖延支付。
三、特殊情况处理
虽然停工留薪期间的工资原则上应包含治疗期间的工资，但在某些特殊情况下，可能需要对绩效工资部分进行合理调整。例如：
绩效与业绩紧密挂钩：若绩效工资完全取决于特定工作任务或项目成果，且停工留薪期间职工无法完成这些任务，单位可根据实际情况合理调整绩效工资部分。但这种情况需要单位与职工进行充分协商，并确保调整后的工资水平仍能保障职工的基本生活。
单位规章制度：如单位有明确的绩效工资制度，并对停工留薪等特殊情况有预先规定，且不违反法律法规，可按制度执行。但同样需要确保这些规定不会损害工伤职工的合法权益。
四、法律建议
了解自身权益：工伤职工应充分了解自己在停工留薪期间的工资福利待遇，确保用人单位按时足额支付。
保留相关证据：如工资条、劳动合同、工伤认定书等，以便在发生争议时维护自己的合法权益。
及时沟通协商：如用人单位对停工留薪期间的工资支付存在疑问或争议，工伤职工应及时与用人单位沟通协商，寻求合理解决方案。
寻求法律援助：如协商无果，工伤职工可以向当地劳动保障部门投诉或寻求法律援助，以维护自己的合法权益。
综上所述，停工留薪工资确实包括治疗期间的工资，且应包含职工正常工作时的全部收入和福利。在特殊情况下，可能需要对绩效工资部分进行合理调整，但必须确保调整后的工资水平仍能保障职工的基本生活。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。