工厂员工连续旷工两天，可能会面临从警告、扣减工资到解除劳动合同等一系列后果，具体需依据工厂的规章制度及《中华人民共和国劳动法》、《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定来执行。以下是对此问题的详细分析：
一、规章制度层面的后果
纪律处分：
- 工厂对于首次旷工的员工，通常会给予口头或书面警告，提醒员工其行为的严重性，并要求反思。
- 若员工连续旷工两天，根据规章制度的严厉程度，可能会升级为全厂通报批评、由主管领导谈话，并给予记过、降级等更严厉的处分。这些记录将对员工后续的绩效考核、晋升等产生负面影响。
经济处罚：
- 旷工期间，员工通常无出勤工资，且工厂可能按规章制度对旷工行为进行额外罚款。但需注意，企业对员工的罚款权在法律上有限制，必须基于明确的法律依据或经过民主程序制定且合理的规章制度。
- 扣除当月绩效奖金、全勤奖及其他相关福利，如岗位津贴等。
- 在一些有福利积分制度的工厂，旷工还可能导致积分扣除，进而影响员工兑换福利或参与特殊项目的资格。
行政影响：
- 对于管理严格的工厂，严重或多次旷工的员工可能会被列入企业黑名单，影响其未来在同行业其他工厂的求职机会。
二、劳动合同解除层面的后果
解除条件：
- 如果工厂的规章制度中明确规定，连续旷工达到一定天数（如两天）属于严重违反规章制度的行为，工厂有权依据《中华人民共和国劳动法》第二十五条以及《中华人民共和国劳动合同法》第三十九条的规定，以严重违纪为由解除与员工的劳动合同。
解除程序：
- 工厂在解除劳动合同前，应确保规章制度的制定程序合法（如经过民主程序制定并向员工公示）。
- 解除劳动合同的通知需以合法、有效的方式送达员工，否则可能面临违法解除劳动合同的法律风险，需要支付赔偿金。
- 按离职要求办理离职手续，向劳动者出具离职证明，并结清工资等。
三、建议与防范措施
- 员工方面：若因特殊原因导致无法正常出勤，应及时与工厂相关负责人沟通请假事宜，避免因旷工产生不必要的纠纷和损失。
- 工厂方面：
- 在制定规章制度时，应确保内容合法、合理，并严格按照法律程序进行公示和执行。
- 在处理旷工问题时，应遵循相关法律法规，尊重员工的合法权益，避免随意解雇员工。
- 加强内部管理和沟通机制建设，提高员工的工作积极性和责任感，以维护企业的正常运营和良好的工作氛围。
示例说明：假设某工厂的规章制度中明确规定，连续旷工两天属于严重违反规章制度的行为，工厂有权解除劳动合同。若某员工连续旷工两天，工厂在确认其旷工事实后，可以依据规章制度和法律规定，解除与该员工的劳动合同，并无需支付经济补偿。但若工厂的规章制度中未明确规定连续旷工两天的后果，或规章制度制定程序不合法，则工厂可能无法直接解除劳动合同，而需采取其他纪律处分措施。
综上所述，工厂员工连续旷工两天的后果是严重的，不仅可能面临经济上的损失，还可能影响职业生涯的发展。因此，建议员工严格遵守工厂的规章制度，按时出勤；同时，工厂也应依法依规进行管理，确保劳动关系的和谐稳定。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。