不动产所有人可以协议只处置房屋所有权，但这一行为需要满足一定的法律条件和程序。以下从不同角度为您详细分析：
一、法律基础与原则
根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，不动产权利人对其不动产享有占有、使用、收益和处分的权利。这包括房屋所有权和土地使用权。然而，房屋所有权和土地使用权在法律上通常是紧密相连的，尤其是在城市房地产领域，实行“房地一体”原则。这意味着，在处置房屋所有权时，往往也会涉及到土地使用权的处置。但这并不意味着不能单独处置房屋所有权，只是在实际操作中需要特别注意法律程序和合同条款的设定。
二、单独处置房屋所有权的可行性
协议约定：不动产所有人之间可以通过协议的方式，明确约定只处置房屋所有权，而不涉及土地使用权。这种协议在法律上是有效的，只要它不违反法律、行政法规的强制性规定，也不违背公序良俗。
登记手续：为了确保协议的效力，双方需要到不动产登记机构办理房屋所有权的变更登记手续。在登记时，需要明确说明只处置房屋所有权，并可能需要根据当地不动产登记机构的要求提供相关证明材料。
土地使用权处理：虽然协议可以约定只处置房屋所有权，但土地使用权的问题仍然需要妥善处理。如果房屋所有权转移后，原所有人仍然保留土地使用权，那么需要明确双方对土地使用权的权利和义务，以避免后续纠纷。如果土地使用权也一并转移，那么需要在协议中明确约定，并办理相应的土地使用权变更登记手续。
三、可能遇到的法律问题与风险
法律限制：在某些特定情况下，法律可能对单独处置房屋所有权有所限制。例如，如果房屋位于划拨土地上，或者房屋所有权与土地使用权存在其他法律上的关联关系，那么单独处置房屋所有权可能会受到法律限制。
合同风险：如果协议条款设置不当或者不明确，可能会导致双方对协议内容产生争议。例如，如果协议中没有明确约定土地使用权的处理方式，那么后续可能会因为土地使用权问题而产生纠纷。
登记风险：如果未按照法律规定办理房屋所有权变更登记手续，或者登记手续存在瑕疵，那么可能会影响协议的效力。这可能导致房屋所有权无法顺利转移，或者产生其他法律纠纷。
四、建议与措施
咨询专业律师：在协议处置房屋所有权之前，建议咨询专业律师，了解相关法律规定和程序要求，以确保协议的合法性和有效性。
明确协议条款：在协议中明确约定房屋所有权的处置方式、土地使用权的处理方式、双方的权利和义务等关键条款，以避免后续纠纷。
办理登记手续：按照法律规定办理房屋所有权变更登记手续，并确保登记手续的真实、合法和有效。
如果您在不动产处置方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。我会根据您的具体情况，为您提供专业、全面的法律建议。