协议中涂改“甲乙”两个字，其法律效力及处理方式需根据具体情况来判断。以下是从不同角度为你详细分析的情况及建议：
一、涂改是否影响协议整体效力
若涂改未经双方同意：
- 法律效力：根据《民法典》的相关规定，合同（协议）的变更需经双方协商一致。若一方擅自涂改协议中的“甲乙”字样，且未得到另一方的认可，该涂改部分通常视为无效，不影响协议其他部分的效力。但若涂改内容涉及协议的核心条款，如双方权利义务、违约责任等，且该涂改导致协议内容显失公平或违反法律法规的强制性规定，则整个协议可能因涂改而部分或全部无效。
- 建议：若发现协议被擅自涂改，应立即与对方沟通，要求恢复原状或重新签订协议。若对方拒绝，可考虑通过法律途径维护自身权益。
若涂改经双方同意：
- 法律效力：若双方就涂改内容达成一致，并签字或盖章确认，则涂改部分具有法律效力，成为协议的一部分。
- 建议：为确保涂改内容的明确性和可追溯性，建议在涂改处加盖双方公章或签字确认，并注明涂改日期。同时，保留好相关证据，如沟通记录、邮件往来等，以备不时之需。
二、涂改可能引发的法律风险及防范
法律风险：
- 协议效力争议：涂改可能导致协议效力受到质疑，引发双方对协议内容的争议。
- 违约责任认定：若涂改内容涉及违约责任等关键条款，可能影响违约责任的认定和承担。
- 证据效力问题：涂改后的协议可能因证据效力问题而难以被法院采信，导致一方权益受损。
防范建议：
- 谨慎涂改：在签订协议前，应仔细审查协议内容，确保无误后再签字或盖章。若需涂改，应经双方协商一致，并按照规范流程进行。
- 保留证据：涂改协议时，应保留好相关证据，如沟通记录、邮件往来、涂改前后的协议复印件等，以备不时之需。
- 寻求专业帮助：若对协议涂改的法律效力或处理方式存在疑问，可咨询专业律师，以获取更准确的法律意见。
三、具体处理步骤
- 沟通协商：发现协议被涂改后，首先应与对方进行沟通协商，了解涂改的原因和目的，并尝试达成一致意见。
- 恢复原状或重新签订：若涂改未经双方同意或涂改内容存在争议，可要求对方恢复原状或重新签订协议。
- 法律途径：若沟通协商无果，且涂改内容涉及自身重大权益，可考虑通过法律途径维护自身权益，如向法院提起诉讼或申请仲裁。
如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。我将根据你的具体情况，为你提供更详细、更专业的法律意见。