仲裁员工和普通员工在补偿方面，本质上并无区别，均需依据《劳动合同法》等相关法律法规来确定补偿标准和方式。不过，在具体情境下，两者可能因离职原因、劳动合同条款等因素而有所差异。以下从不同角度详细分析：
一、离职原因对补偿的影响
协商一致解除劳动合同：
- 无论是仲裁员工还是普通员工，若双方协商一致解除劳动合同，用人单位通常需按照劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付经济补偿。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。
用人单位单方面解除劳动合同：
- 若用人单位因劳动者严重违反规章制度、严重失职等过错行为而单方面解除劳动合同，且解除行为合法，则用人单位无需支付经济补偿。这一规定同样适用于仲裁员工和普通员工。
- 若用人单位无正当理由单方面解除劳动合同，或解除行为违法，则需按照经济补偿标准的二倍向劳动者支付赔偿金。
劳动者单方面解除劳动合同：
- 若劳动者因用人单位未提供劳动保护、未及时足额支付劳动报酬等过错行为而单方面解除劳动合同，用人单位需支付经济补偿。
- 若劳动者因个人原因（如家庭、健康等）单方面解除劳动合同，且未提前通知用人单位或未按照劳动合同约定履行通知义务，则用人单位可能无需支付经济补偿。不过，这一规定并不因员工是否涉及仲裁而有所区别。
二、劳动合同条款对补偿的影响
- 劳动合同中可能包含关于补偿的特定条款，如约定在特定情况下用人单位需支付额外的补偿金或奖金。这些条款对仲裁员工和普通员工同样适用，但具体条款内容可能因劳动合同而异。
三、仲裁程序对补偿的间接影响
- 仲裁程序本身并不直接影响补偿的标准和方式，但它可能通过确认劳动关系、解除劳动合同的合法性等事项，间接影响补偿的确定。例如，若仲裁裁决确认用人单位违法解除劳动合同，则用人单位需支付赔偿金；若裁决确认劳动者存在过错行为，则可能免除用人单位支付经济补偿的义务。
四、特殊情况下的补偿差异
- 在某些特殊情况下，如劳动者因工负伤或患职业病并被确认丧失或部分丧失劳动能力，或劳动者在孕期、产期、哺乳期等特定时期被解除劳动合同，补偿标准和方式可能有所不同。这些规定同样适用于仲裁员工和普通员工，但具体适用情况需根据法律法规和劳动合同来确定。
总结与建议：
- 仲裁员工和普通员工在补偿方面并无本质区别，均需依据法律法规和劳动合同来确定补偿标准和方式。
- 在离职过程中，建议双方充分沟通、协商，并尽量达成一致意见，以避免不必要的纠纷和损失。
- 若涉及仲裁程序，建议双方积极配合仲裁机构的工作，提供真实、完整的证据材料，以便仲裁机构能够准确、公正地作出裁决。
- 如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我将竭诚为您提供专业的法律服务。