企业因适用税率错误导致少缴纳1000万税款，将可能面临以下法律责任：

1. 税务行政处罚：

   • 补缴税款：企业首先需要补缴因税率错误而少缴纳的1000万税款。这是最基本的法律责任，也是税务机关对企业税务违规行为的首要处理措施。
   • 滞纳金：根据《中华人民共和国税收征收管理法》的相关规定，企业未按照规定期限缴纳税款的，税务机关除责令限期缴纳外，从滞纳税款之日起，按日加收滞纳税款万分之五的滞纳金。因此，企业还需支付相应的滞纳金。
   • 罚款：税务机关在责令企业补缴税款和滞纳金的同时，还可能根据情节的严重程度，对企业处以罚款。罚款的数额通常根据少缴税款的金额和违规情节的轻重来确定，可能达到少缴税款的数倍。

2. 刑事责任风险：

   • 逃税罪：如果企业的少缴税款行为被认定为故意隐瞒、虚报等逃避缴纳税款的行为，且数额较大、情节严重，那么企业及其直接负责的主管人员和其他直接责任人员可能构成逃税罪。根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，逃税罪的刑罚包括有期徒刑、拘役和罚金等。
   • 其他相关犯罪：如果企业的少缴税款行为还涉及其他违法犯罪行为，如伪造、变造、隐匿、擅自销毁帐簿、记帐凭证等，那么企业及其相关人员还可能构成其他相关犯罪，如妨害清算罪、隐匿、故意销毁会计凭证、会计帐簿、财务会计报告罪等。

3. 信用记录受损：

   • 企业的税务违规行为还会被记录在税务机关的信用系统中，对企业的信用评级产生负面影响。这可能导致企业在未来的税务申报、税务稽查等方面受到更加严格的监管和审查，甚至可能影响企业的融资、招投标等经济活动。

法律建议：

• 主动纠正：一旦发现适用税率错误导致少缴纳税款的情况，企业应立即主动向税务机关申报并补缴税款和滞纳金，以减轻可能的法律责任。
• 配合调查：在税务机关进行税务稽查或调查时，企业应积极配合，提供必要的资料和证据，以证明自己的违规行为并非故意或恶意。
• 加强内部管理：企业应加强内部税务管理，完善税务申报和缴纳流程，确保税务申报的准确性和及时性，避免类似问题的再次发生。

后续行动建议：

• 如果您是企业负责人或财务人员，面对此类问题，建议立即咨询专业税务律师或税务顾问，以获取更具体的法律建议和操作指导。
• 同时，企业应组织内部培训，提高员工的税务意识和法律意识，确保企业在税务合规方面做到万无一失。

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