在合同订立时适用的国家标准发生更新，纠纷中究竟适用新标准还是旧标准，这主要取决于合同的具体约定以及相关法律法规的规定，以下分情况讨论：
合同有明确约定：
- 如果合同中明确规定了适用的国家标准版本，或者约定了标准更新时的处理方式（如自动适用新标准、双方协商适用新标准等），那么应当按照合同中的约定来执行。这是合同自治原则的体现，即合同双方有权在合同中约定各自的权利和义务，包括适用标准的版本。
合同无明确约定：
- 一般原则：在合同没有明确约定的情况下，通常适用合同订立时已经存在的国家标准。这是因为合同是双方意思表示一致的产物，合同订立时的环境、条件等都是双方考虑的因素，包括当时适用的国家标准。因此，在合同没有特别约定的情况下，按照合同订立时的标准执行是合理的。
- 例外情况：然而，也存在一些例外情况。例如，如果新标准是为了保护公共利益、消费者权益或环境安全等而制定的，且这些利益在合同订立时可能并未被充分预见或考虑，那么法院或仲裁机构可能会倾向于适用新标准。此外，如果新标准的实施并不对合同双方造成实质性的不公平或负担，且符合法律法规的强制性规定，也可能适用新标准。但这种情况需要具体案件具体分析，不能一概而论。
法律法规的强制性规定：
- 除了合同约定外，还需要考虑法律法规的强制性规定。如果新标准是由法律法规明确规定必须适用的，那么无论合同中是否有约定，都应当适用新标准。这是因为法律法规的强制性规定具有更高的法律效力，必须得到遵守。
法律建议：
- 在签订合同时，建议双方明确约定适用的国家标准版本以及标准更新时的处理方式，以避免未来可能出现的纠纷。
- 如果合同中没有明确约定，且发生了国家标准更新导致的纠纷，建议双方首先通过协商解决。如果协商不成，可以寻求法律途径解决，如提起诉讼或申请仲裁。
- 在处理此类纠纷时，建议咨询专业律师的意见，以便更好地维护自己的合法权益。
可能法律后果：
- 如果违反法律法规的强制性规定而适用旧标准，可能会面临法律制裁或承担不利后果。
- 如果合同双方因标准更新问题产生纠纷且无法协商解决，可能会影响合同的履行和双方的商业关系。因此，建议双方在合同订立和履行过程中保持沟通，及时协商解决可能出现的问题。