当申请人提出的是行政补偿之诉，但实质是赔偿之诉时，法院会依据案件的具体情况和相关法律法规进行审理，主要会从以下几个方面进行考量：

1. 区分补偿与赔偿的法律性质：
   • 行政补偿：通常是因为行政机关的合法行为给公民、法人或其他组织造成了损失，为了弥补这种损失而进行的补偿。它基于的是合法行政行为造成的损失，具有补偿性。
   • 行政赔偿：则是因为行政机关的违法行为给公民、法人或其他组织造成了损害，为了赔偿这种损害而进行的赔偿。它基于的是违法行政行为造成的损害，具有赔偿性。

法院在审理时，会首先明确申请人提出的是补偿之诉还是赔偿之诉，以及案件事实更符合哪一种法律性质。如果申请人虽然名义上提出的是补偿之诉，但实质上是因为行政机关的违法行为造成了损害，那么法院可能会将其视为赔偿之诉进行审理。

1. 审查案件事实与证据：

   • 法院会详细审查案件的事实和证据，包括行政机关的行为是否合法、申请人的损失是否由行政机关的行为造成、损失的具体数额等。
   • 如果申请人提出的补偿请求实际上是基于行政机关的违法行为，那么法院会要求申请人提供充分的证据来证明这一点，如行政机关的违法决定、申请人的损失证明等。

2. 适用相关法律法规：

   • 根据案件的具体情况，法院会适用相关的法律法规进行审理。如果案件实质上是赔偿之诉，那么法院会依据《中华人民共和国国家赔偿法》等相关法律法规进行审理。
   • 法院会判断行政机关的行为是否违法，以及违法行为与申请人损失之间的因果关系，从而确定是否应当给予赔偿以及赔偿的数额。

3. 可能的审理结果：

   • 如果法院认定案件实质上是赔偿之诉，且行政机关的行为确实违法并给申请人造成了损害，那么法院可能会判决行政机关承担赔偿责任，赔偿申请人的损失。
   • 如果法院认定案件仍然是补偿之诉，且行政机关的行为合法但给申请人造成了损失，那么法院可能会判决行政机关给予适当的补偿。
   • 如果法院认为申请人的请求缺乏事实或法律依据，那么可能会驳回申请人的诉讼请求。

举例说明：

假设申请人因行政机关的违法拆迁行为导致房屋被拆除，申请人原本可能以补偿之名提起诉讼，但实质上是要求赔偿。法院在审理时，会首先审查拆迁行为是否违法，以及申请人的房屋损失是否由拆迁行为造成。如果确认拆迁行为违法且造成了申请人的房屋损失，那么法院会依据《中华人民共和国国家赔偿法》等相关法律法规，判决行政机关承担赔偿责任，赔偿申请人的房屋损失。

建议：

• 如果你在提起行政诉讼时，对案件的性质（补偿还是赔偿）存在疑问，建议咨询专业律师，以便更准确地确定诉讼请求和法律依据。
• 在准备诉讼材料时，务必提供充分的证据来支持你的诉讼请求，无论是补偿还是赔偿，都需要有确凿的证据来证明你的损失和行政机关的行为之间的因果关系。

如有任何法律问题，可以直接向我咨询，我会结合你的具体情况，为你提供专业的法律建议。