结论：有成果文件但没有合同的情况下，能否列入预算需视具体情况而定，主要取决于成果文件的性质、用途以及相关法律法规或合同条款（如有）的规定。以下从不同角度进行分析：

一、成果文件作为预算依据的合法性

1. 合同缺失的影响：

   • 通常情况下，合同是明确双方权利义务、约定交易内容和价格等关键条款的法律文件。在预算编制中，合同往往是确定支出项目和金额的重要依据。
   • 若没有合同，但成果文件（如验收报告、结算单等）能够充分证明实际发生的费用或工作量，且这些费用或工作量与预算编制的目的和范围相符，那么成果文件在一定程度上可以作为预算的参考依据。

2. 法律法规的考量：

   • 根据相关法律法规，预算编制应遵循真实性、合理性、合法性等原则。若成果文件符合这些原则，且没有违反法律法规的强制性规定，那么将其列入预算是合法的。
   • 然而，若成果文件存在虚假、夸大或不符合法律法规规定的情况，则不能将其列入预算，否则可能面临法律风险。

二、成果文件列入预算的实践操作

1. 成果文件的审核：

   • 在将成果文件列入预算前，应对其进行严格审核，确保其真实性、准确性和完整性。审核内容包括但不限于成果文件的签署情况、内容是否与实际相符、是否符合预算编制的要求等。
   • 若成果文件存在瑕疵或疑问，应及时与相关方沟通确认，必要时可要求补充或修正成果文件。

2. 预算编制的灵活性：

   • 在预算编制过程中，应保持一定的灵活性，以适应不同情况下的需求。若因特殊原因（如紧急情况、合同未签订等）无法及时取得合同，但成果文件已充分证明实际发生的费用或工作量，可考虑将成果文件作为预算的临时依据。
   • 但同时应尽快与相关方签订合同或补充协议，以明确双方的权利义务和交易内容，确保预算的合法性和稳定性。

三、风险防范与建议

1. 加强合同管理：

   • 为避免类似情况的发生，建议加强合同管理，确保在交易发生前及时签订合同，并明确约定交易内容、价格、支付方式等关键条款。
   • 同时，应建立完善的合同管理制度和流程，确保合同的签订、履行、变更和解除等环节都得到有效监控和管理。

2. 完善预算编制流程：

   • 在预算编制过程中，应建立完善的审核机制和流程，确保预算的合法性和合理性。对于没有合同但已有成果文件的情况，应进行特别审核和评估，确保其符合预算编制的要求和标准。
   • 同时，应加强与相关方的沟通和协调，及时解决预算编制过程中出现的问题和争议。

总结来说，有成果文件但没有合同的情况下能否列入预算需视具体情况而定。在操作过程中，应严格审核成果文件的真实性、准确性和完整性，并保持预算编制的灵活性。同时，为防范风险，建议加强合同管理和完善预算编制流程。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。