三甲医院合同制员工是否同工同酬，需分情况讨论：
- 法律层面的同工同酬原则
根据《中华人民共和国劳动法》第四十六条，工资分配应当遵循按劳分配原则，实行同工同酬。这意味着，在同一用人单位内，只要劳动者提供了相同价值的劳动，就应当获得相同的劳动报酬，不论其身份是合同制员工还是编制内员工。因此，从法律原则上看，三甲医院合同制员工应当享受同工同酬的待遇。
实际操作中的同工同酬情况
- 合同约定：在实际操作中，三甲医院与合同制员工签订的劳动合同中，通常会明确约定工资待遇、福利待遇等条款。如果合同中明确规定了同工同酬，那么医院就应当按照合同约定执行。
- 医院政策：除了合同约定外，三甲医院还可能根据自身的经营状况和人力资源管理政策，制定不同的薪酬体系。有些医院可能为了吸引和留住人才，会主动给予合同制员工与编制内员工相同的待遇；而有些医院则可能由于资金、编制限制等原因，无法完全实现同工同酬。
- 地区差异：不同地区的三甲医院，由于经济发展水平、财政状况等因素的差异，也可能导致合同制员工的薪酬待遇存在差异。
同工同酬的认定标准
- 工作内容相同：劳动者从事的工作内容、工作性质、工作强度等应当相同或相似。
- 工作成果相同：劳动者的工作成果、工作质量、工作效率等应当相当。
- 工作条件相同：劳动者的工作环境、工作条件、工作风险等应当相似。
如果合同制员工认为自己的薪酬待遇与编制内员工存在明显差异，且不符合同工同酬的原则，可以通过以下途径维护自己的权益：
- 与医院协商：首先可以尝试与医院的人力资源部门或相关负责人进行协商，表达自己的诉求和理由，寻求合理的解决方案。
- 申请劳动仲裁：如果协商无果，可以向当地的劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁，要求医院按照同工同酬的原则支付工资差额等。
- 提起诉讼：如果对劳动仲裁结果不满意，还可以向人民法院提起诉讼，通过法律途径维护自己的合法权益。
总结与建议：三甲医院合同制员工是否同工同酬，取决于合同约定、医院政策以及地区差异等多种因素。如果合同制员工认为自己的薪酬待遇不符合同工同酬的原则，应当积极与医院协商，并寻求法律途径维护自己的权益。如果您有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。