当食品添加被查出时，处理方式主要取决于是否合法合规地使用了食品添加剂。以下是对此问题的详细解答：
一、合法使用食品添加剂的情况
如果企业严格按照《食品安全国家标准 食品添加剂使用标准》（GB2760）规定的范围和限量使用食品添加剂，那么这种行为是合法的，不会受到处罚。例如，在面包中添加规定限量的防腐剂以延长保质期，或在饮料中使用合法的色素改善外观，这些都属于合法使用食品添加剂的情形。
二、违法使用食品添加剂的处罚
如果企业存在以下违法行为，将依法受到严惩：
超范围使用：在允许范围外添加添加剂，如在普通食品中添加仅允许用于保健品的成分。
超限量使用：超出标准规定的最大使用量，如防腐剂添加量超过国标限值。
非法添加非食用物质：添加法律明确禁止的物质，如工业用漂白剂、苏丹红等。
处罚依据与措施：
根据《食品安全法》第124条，违法者将面临没收违法所得、违法生产经营的食品及工具设备，并处以罚款。罚款金额根据货值大小而定，货值不足1万元处5万-10万元罚款，货值1万元以上处货值10倍-20倍罚款。情节严重者，还将被吊销许可证。
如果行为构成生产销售有毒有害食品罪，根据《刑法》第143/144条，违法者将面临5年以下有期徒刑或拘役，并处罚金。如果致人死亡或严重危害健康，处罚将更为严厉，可能处5年以上至无期徒刑。
典型案例：
某酱菜厂因超量使用苯甲酸防腐剂，被处以货值15倍的罚款，并吊销了生产许可证。
某火锅店因非法添加罂粟壳提味，经营者因生产销售有毒有害食品罪被判刑3年。
三、特殊情形的处理原则
标签标识问题：如果产品未标注含添加剂但检测合格，通常会被责令整改。如果故意隐瞒添加剂信息，则可能按虚假宣传进行处罚。
豁免情形：符合GB2760中“带入原则”的微量残留（如原料带入杂质）通常不视为违法。
从轻减轻条件：如果企业主动召回产品、配合调查、消除危害后果，可以从轻处罚。
综上所述，食品添加被查时的处理方式取决于是否合法合规地使用了食品添加剂。合法使用不会受到处罚，而违法使用则将面临严厉的处罚。因此，企业在使用食品添加剂时，务必严格遵守相关法律法规和标准要求。