面对员工恶意告公司无劳动合同的情况，公司可以采取以下措施来应对：

首先，明确结论：公司应积极收集证据，证明劳动关系存在，并根据实际情况判断是否需要支付双倍工资。同时，准备好答辩材料，以应对员工的恶意起诉。

具体应对措施：

1. 收集证据，证明劳动关系：

   • 公司应尽快收集能证明劳动关系的证据，如工资支付记录、工作证、考勤记录、工作安排、培训记录等，这些都能作为双方存在事实劳动关系的佐证。

2. 核实劳动合同签订情况：

   • 查看公司与员工签订劳动合同的实际情况。若确实未签，应梳理未签原因，判断是否存在客观因素，如员工拒绝签订、人事管理疏忽等。

3. 准备答辩材料：

   • 积极准备答辩材料，详细说明情况。可阐述公司在管理过程中虽存在不足，但并无恶意不签合同的主观故意，且已为员工提供劳动条件和报酬等。
   • 同时，关注员工起诉的诉求和证据，若员工证据存在明显瑕疵或不实，可在庭审中予以指出和反驳。

4. 依法支付双倍工资（如适用）：

   • 若经过调查确定双方确实没有劳动合同，且公司无法证明未签合同是员工的责任，那么公司应按照法律规定，给员工支付没签劳动合同期间的双倍工资。但要注意，这一诉求通常有一年的诉讼时效。

5. 追究员工赔偿责任（如适用）：

   • 若员工恶意诉讼给公司造成损失，公司可考虑依法追究其赔偿责任。

法律建议：

• 公司应始终依据事实和法律规定来合理维护自身权益，积极应对员工的恶意起诉，避免自身合法权益受损。
• 在处理此类纠纷时，建议公司保持冷静和理性，避免情绪化应对，以免进一步激化矛盾。
• 若公司在处理过程中遇到法律难题或需要进一步的法律支持，可随时向我咨询，我会提供专业的法律意见和帮助。