怀孕了不能上班，是否有工资取决于具体情况。以下是对此问题的详细分析：

1. 依法请假的情况：

   • 病假：如果女职工因怀孕身体不适需要请假休息，并提供了正规医院的诊断证明等相关材料，公司应按照病假处理。病假期间，公司应支付病假工资，且病假工资不得低于当地最低工资标准的80%。
   • 产假：女职工生育享受产假，产假期间工资照发。对于已经参加生育保险的女职工，产假期间的生育津贴由生育保险基金支付；未参加生育保险的，则由用人单位支付。
   • 哺乳假：有不满1周岁婴儿的女职工，在哺乳时间内公司应当正常支付工资。

2. 未经请假擅自不上班的情况：

   • 如果女职工没有按照公司规定的请假流程，擅自不来上班，这属于旷工行为。公司可以根据规章制度对旷工行为进行处理，这种情况下公司可以不发放旷工期间的工资，甚至有权解除劳动合同。

3. 特殊保护规定：

   • 女职工在孕期、产期、哺乳期期间，公司不能随意解除劳动合同，且劳动合同应续延至这些特殊时期结束。

综上所述，怀孕期间不能上班时，公司是否发工资取决于女职工不能上班的具体原因以及是否按照公司规定和法律要求进行了相应处理。如果女职工因合法原因请假，公司应按规定支付工资或生育津贴；如果女职工未经请假擅自不上班，公司则有权不支付工资甚至解除劳动合同。建议女职工在怀孕期间与公司保持良好沟通，明确请假流程和所需材料，以确保自身权益得到保障。如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的帮助，请直接向我咨询。