针对您提出的“药店质量负责人（通常也具备执业药师身份）辞职后如何注销”的问题，这是一个涉及企业登记信息变更与执业药师注册信息双重注销的复杂流程。以下是我为您详细梳理的注销步骤及注意事项：
一、企业登记信息变更（注销原质量负责人身份）
内部决策与确定继任者：
- 药店需通过内部决策机构（如股东会或董事会）决定注销原质量负责人，并确定新的质量负责人。新负责人需符合相关法律法规及企业内部规定的要求，通常应具备相应的药学专业背景和资质。
准备并提交相关文件：
- 包括企业变更登记申请书，明确变更事项为质量负责人的变更；
- 新质量负责人的身份证明文件，如身份证复印件、药学专业资格证书等；
- 公司章程修正案（如有需要，反映质量负责人变更的内容）；
- 药店的营业执照正副本，用于更新登记信息。
- 将这些文件提交至当地工商行政管理部门（市场监督管理局窗口），您可以选择线上或线下方式提交。
审核与核准：
- 工商部门将对您的申请材料进行审核，确保材料齐全、真实有效。
- 审核通过后，工商部门将予以核准登记，并换发新的营业执照，标志着原质量负责人的身份在企业登记层面完成变更注销。
税务处理（如适用）：
- 如果药店因此次变更而涉及税务方面的调整，如税务登记信息的变更或税务清算等，您需要确保完成所有税务申报和缴纳工作，并取得税务部门的相应证明。
二、执业药师注册变更（注销原质量负责人相关注册信息）
提出申请：
- 您需要登录国家药品监督管理局的网络服务平台，填写并打印《执业药师注销注册申请表》，明确申请注销的原因和事项。
准备并提交材料：
- 包括《执业药师注销注册申请表》；
- 您的执业药师资格证书原件及复印件，作为身份和资质的证明；
- 身份证明文件，如身份证复印件；
- 如果您已找到新的工作单位，需要提供与新工作单位的相关证明，如新药店的营业执照副本复印件；
- 与原药店解除劳动关系的证明，如离职证明或解除劳动合同协议等。
- 将这些材料提交至当地药品监督管理部门指定的注册机构，同样可以选择线上或线下方式提交。
审核与审批：
- 注册机构将对您的申请材料进行审核，核实其真实性和完整性。
- 审核通过后，注册机构将在执业药师注册管理系统中完成变更注册操作，并发放新的《执业药师注册证》，同时注销原质量负责人相关的执业药师注册信息。
三、注意事项
合规性：在整个注销过程中，您必须严格遵守相关法律法规和操作指南，确保每一步都合法合规，避免法律风险。
员工安置与交接：如果您在药店中担任其他职务或涉及员工管理，因辞职导致的员工变动应妥善处理，如支付经济补偿、办理社保转移等。同时，确保与新质量负责人或药店管理层进行充分的交接工作，确保药店运营的连续性和稳定性。
咨询专业指导：鉴于注销流程的复杂性和专业性，我建议您咨询专业律师或相关服务机构以获取专业指导。他们可以提供更具体、更针对性的建议，帮助您更有效地完成注销流程，降低潜在的法律风险。
综上所述，药店质量负责人辞职后的注销流程涉及企业登记信息变更和执业药师注册信息注销两个方面。您需要按照上述步骤逐一完成，并密切关注相关法律法规的要求和操作指南的更新。通过咨询专业律师或相关服务机构，您可以更顺利地完成注销流程。