关于单位员工直系亲属死亡时，单位派出的慰问旅差费是否可以核销的问题，这主要取决于单位的具体规章制度以及地方性的相关政策规定。以下是一些详细的分析和建议：
首先，从一般性的角度来看，单位是否核销慰问旅差费并非由统一的法律法规直接规定，而是更多地依赖于单位内部的财务管理制度和员工福利政策。因此，不同单位可能会有不同的处理方式。
接下来，我们参考一些地方性的政策规定来进一步分析。以广东省为例，根据《广东省职工假期待遇和死亡抚恤待遇规定》的通知（粤人社规〔2023〕17号），其中明确规定了职工的直系亲属（父母、配偶、子女）死亡时，职工可以享受3天丧假，并且如果需要到外地料理丧事，可以根据路程远近给予路程假。然而，该规定中并未直接提及慰问旅差费的核销问题，只是说明了途中交通费由职工自理。
这并不意味着单位不能根据自身情况制定更为优厚的福利政策。实际上，许多单位为了体现对员工的关怀和支持，可能会选择核销慰问旅差费或者提供其他形式的补助。这种做法既有助于增强员工的归属感和忠诚度，也有助于提升单位的整体形象和企业文化。
因此，我建议您采取以下步骤来获取更准确的答案：
查阅单位内部的财务管理制度和员工福利政策：这些文件通常会详细规定单位在处理类似情况时的具体做法和标准。
咨询单位的人力资源部门或财务部门：他们作为负责员工福利和财务管理的专业部门，能够为您提供最直接和准确的解答。
参考地方性的相关政策规定：虽然这些规定可能不会直接涉及慰问旅差费的核销问题，但它们可以为您提供一个更广泛的政策背景和参考框架。
综上所述，单位员工直系亲属死亡时单位派出的慰问旅差费是否可以核销，主要取决于单位的具体规章制度和地方性的相关政策规定。为了获取最准确的答案，我建议您查阅单位内部的相关文件或咨询相关部门的工作人员。