结论：再审申请驳回已经超过两年后才发现新证据，一般情况下不可以直接向检察院提起抗诉，但存在特殊情形时，仍有可能通过其他途径寻求救济。

分析说明：

1. 一般情况下的规定：

   • 根据《中华人民共和国民事诉讼法》及相关司法解释，当事人申请再审应当在判决、裁定发生法律效力后六个月内提出。若因新证据等特定事由申请再审，也需在知道或应当知道该事由之日起六个月内提出。
   • 在您描述的情况下，再审申请已经被驳回，且已经超过两年时间，从常规程序上看，已经超过了法定的再审申请期限。

2. 特殊情形的考虑：

   • 新证据的特殊性：虽然新证据的发现通常需要在法定期限内提出再审申请，但如果该新证据具有极其重大的意义，且能够直接证明原判决、裁定存在错误，理论上仍有可能通过其他途径寻求救济。然而，这并不意味着可以直接向检察院提起抗诉。
   • 检察院抗诉的条件：检察院抗诉通常针对的是已经发生法律效力的判决、裁定，且认为这些判决、裁定在认定事实、适用法律等方面存在错误。但抗诉的提起也需遵循一定的程序和时限，并非随时可以提起。
   • 其他救济途径：在超过再审申请期限且无法直接抗诉的情况下，当事人可以考虑通过申诉、信访等方式向相关部门反映情况，寻求可能的救济。但这些途径并不保证能够改变原判决、裁定的结果。

3. 实际操作建议：

   • 尽快咨询专业律师：由于法律程序复杂且时限严格，建议您尽快咨询专业律师，详细了解您的具体情况和可能的救济途径。
   • 准备相关证据：如果您认为新证据具有重大意义，应尽快收集、整理相关证据，以便在可能的救济程序中使用。
   • 遵循法律程序：在寻求救济的过程中，务必遵循法律程序，不要采取非法手段或试图绕过法律程序来解决问题。

特殊场景：

• 如果新证据是在极其特殊的情况下发现的，且该证据能够直接证明原判决、裁定存在重大错误，您可以尝试向原审法院或上级法院提出申诉，并附上新证据。但请注意，这并不保证能够启动再审程序或改变原判决、裁定的结果。

行动建议：

• 鉴于您的情况已经超过法定的再审申请期限，且直接向检察院提起抗诉的可能性较小，我建议您尽快咨询专业律师，详细了解您的具体情况和可能的救济途径。同时，准备好相关证据，以便在可能的救济程序中使用。如果您有任何法律问题或需要进一步的帮助，请直接向我咨询。