医疗期间两年补偿金是否计算，需根据具体情形判断，主要涉及医疗期解除劳动合同的经济补偿与医疗补助费问题，以下分情况说明：

1. 医疗期满后解除劳动合同的经济补偿
   根据《劳动合同法》第四十条，劳动者患病或非因工负伤，在规定的医疗期满后不能从事原工作，也不能从事用人单位另行安排的工作的，用人单位提前三十日以书面形式通知劳动者本人或额外支付一个月工资后，可以解除劳动合同。此时，用人单位需支付经济补偿，标准为按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资（六个月以上不满一年的按一年计算，不满六个月的支付半个月工资）。若医疗期为两年（如实际工作年限十年以上），且劳动者符合上述解除条件，则经济补偿需计算两年对应的工龄部分。

2. 医疗补助费的特殊情形
   根据原劳动部《违反和解除劳动合同的经济补偿办法》（虽已废止，但部分地区仍参照执行）及地方规定，若劳动者经劳动能力鉴定委员会鉴定为完全丧失劳动能力或大部分丧失劳动能力，且用人单位解除劳动合同的，除经济补偿外，还需支付医疗补助费。医疗补助费标准通常为6-12个月工资（具体由地方规定），此时“两年”可能作为医疗期长度影响补助费计算（如部分地区规定医疗期每满一年增发一个月补助费），但需以地方政策为准。

3. 医疗期内不得解除合同的例外
   若劳动者在医疗期内（如两年内），用人单位不得依据《劳动合同法》第四十条、第四十一条解除劳动合同（除劳动者存在第三十九条过错情形外）。若用人单位违法解除，需支付赔偿金（经济补偿标准的二倍），此时“两年”医疗期内的工龄需全额计入赔偿金计算基数。

建议：

• 核实当地医疗期规定（如《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》中根据工龄划分的医疗期长度）；
  
• 若涉及解除合同，要求用人单位出具书面通知及劳动能力鉴定结论；
  
• 如有争议，可申请劳动仲裁，主张经济补偿或赔偿金及医疗补助费。
  

具体计算需结合工龄、工资标准及地方政策，如有疑问可进一步提供细节向我咨询。